Protein–RNA interactions for Protein: Q96AD5

PNPLA2, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA2Q96AD5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PNPLA2Q96AD5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNPLA2Q96AD5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNPLA2Q96AD5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA2Q96AD5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA2Q96AD5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA2Q96AD5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA2Q96AD5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA2Q96AD5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNPLA2Q96AD5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PNPLA2Q96AD5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNPLA2Q96AD5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNPLA2Q96AD5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNPLA2Q96AD5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNPLA2Q96AD5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNPLA2Q96AD5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNPLA2Q96AD5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNPLA2Q96AD5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNPLA2Q96AD5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNPLA2Q96AD5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNPLA2Q96AD5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNPLA2Q96AD5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNPLA2Q96AD5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PNPLA2Q96AD5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNPLA2Q96AD5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNPLA2Q96AD5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNPLA2Q96AD5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNPLA2Q96AD5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNPLA2Q96AD5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNPLA2Q96AD5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNPLA2Q96AD5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNPLA2Q96AD5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA2Q96AD5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA2Q96AD5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA2Q96AD5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA2Q96AD5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA2Q96AD5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PNPLA2Q96AD5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNPLA2Q96AD5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNPLA2Q96AD5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNPLA2Q96AD5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNPLA2Q96AD5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNPLA2Q96AD5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNPLA2Q96AD5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNPLA2Q96AD5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNPLA2Q96AD5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNPLA2Q96AD5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNPLA2Q96AD5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNPLA2Q96AD5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNPLA2Q96AD5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNPLA2Q96AD5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNPLA2Q96AD5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNPLA2Q96AD5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNPLA2Q96AD5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNPLA2Q96AD5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNPLA2Q96AD5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNPLA2Q96AD5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNPLA2Q96AD5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA2Q96AD5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA2Q96AD5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA2Q96AD5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA2Q96AD5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNPLA2Q96AD5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PNPLA2Q96AD5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNPLA2Q96AD5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA2Q96AD5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA2Q96AD5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA2Q96AD5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA2Q96AD5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNPLA2Q96AD5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNPLA2Q96AD5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNPLA2Q96AD5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PNPLA2Q96AD5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PNPLA2Q96AD5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PNPLA2Q96AD5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PNPLA2Q96AD5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PNPLA2Q96AD5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PNPLA2Q96AD5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PNPLA2Q96AD5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PNPLA2Q96AD5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PNPLA2Q96AD5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNPLA2Q96AD5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PNPLA2Q96AD5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNPLA2Q96AD5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNPLA2Q96AD5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNPLA2Q96AD5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNPLA2Q96AD5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNPLA2Q96AD5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNPLA2Q96AD5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNPLA2Q96AD5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNPLA2Q96AD5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNPLA2Q96AD5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNPLA2Q96AD5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNPLA2Q96AD5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNPLA2Q96AD5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNPLA2Q96AD5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNPLA2Q96AD5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNPLA2Q96AD5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNPLA2Q96AD5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNPLA2Q96AD5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms