Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BHMTQ93088 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BHMTQ93088 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BHMTQ93088 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BHMTQ93088 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BHMTQ93088 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BHMTQ93088 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
BHMTQ93088 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BHMTQ93088 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BHMTQ93088 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BHMTQ93088 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BHMTQ93088 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BHMTQ93088 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BHMTQ93088 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BHMTQ93088 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BHMTQ93088 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BHMTQ93088 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BHMTQ93088 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BHMTQ93088 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BHMTQ93088 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BHMTQ93088 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
BHMTQ93088 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BHMTQ93088 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BHMTQ93088 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BHMTQ93088 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BHMTQ93088 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BHMTQ93088 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BHMTQ93088 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BHMTQ93088 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BHMTQ93088 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BHMTQ93088 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BHMTQ93088 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BHMTQ93088 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BHMTQ93088 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BHMTQ93088 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
BHMTQ93088 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BHMTQ93088 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BHMTQ93088 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BHMTQ93088 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BHMTQ93088 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BHMTQ93088 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BHMTQ93088 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BHMTQ93088 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BHMTQ93088 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BHMTQ93088 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BHMTQ93088 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BHMTQ93088 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BHMTQ93088 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BHMTQ93088 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BHMTQ93088 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BHMTQ93088 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
BHMTQ93088 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BHMTQ93088 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BHMTQ93088 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BHMTQ93088 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BHMTQ93088 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BHMTQ93088 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BHMTQ93088 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BHMTQ93088 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
BHMTQ93088 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
BHMTQ93088 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
BHMTQ93088 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
BHMTQ93088 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BHMTQ93088 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BHMTQ93088 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BHMTQ93088 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BHMTQ93088 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
BHMTQ93088 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BHMTQ93088 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BHMTQ93088 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BHMTQ93088 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
BHMTQ93088 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
BHMTQ93088 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BHMTQ93088 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BHMTQ93088 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BHMTQ93088 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BHMTQ93088 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
BHMTQ93088 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BHMTQ93088 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BHMTQ93088 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BHMTQ93088 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BHMTQ93088 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BHMTQ93088 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BHMTQ93088 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BHMTQ93088 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BHMTQ93088 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BHMTQ93088 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BHMTQ93088 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
BHMTQ93088 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BHMTQ93088 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BHMTQ93088 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BHMTQ93088 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BHMTQ93088 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BHMTQ93088 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BHMTQ93088 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BHMTQ93088 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BHMTQ93088 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BHMTQ93088 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BHMTQ93088 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BHMTQ93088 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms