Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJA4Q8WW22 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJA4Q8WW22 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJA4Q8WW22 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJA4Q8WW22 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJA4Q8WW22 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJA4Q8WW22 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJA4Q8WW22 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJA4Q8WW22 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAJA4Q8WW22 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAJA4Q8WW22 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAJA4Q8WW22 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAJA4Q8WW22 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJA4Q8WW22 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJA4Q8WW22 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJA4Q8WW22 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJA4Q8WW22 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJA4Q8WW22 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJA4Q8WW22 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJA4Q8WW22 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJA4Q8WW22 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJA4Q8WW22 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJA4Q8WW22 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJA4Q8WW22 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJA4Q8WW22 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJA4Q8WW22 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJA4Q8WW22 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJA4Q8WW22 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJA4Q8WW22 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAJA4Q8WW22 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAJA4Q8WW22 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJA4Q8WW22 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJA4Q8WW22 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DNAJA4Q8WW22 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAJA4Q8WW22 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAJA4Q8WW22 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAJA4Q8WW22 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAJA4Q8WW22 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJA4Q8WW22 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJA4Q8WW22 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJA4Q8WW22 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJA4Q8WW22 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJA4Q8WW22 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJA4Q8WW22 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJA4Q8WW22 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJA4Q8WW22 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJA4Q8WW22 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJA4Q8WW22 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJA4Q8WW22 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNAJA4Q8WW22 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNAJA4Q8WW22 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNAJA4Q8WW22 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNAJA4Q8WW22 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAJA4Q8WW22 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAJA4Q8WW22 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAJA4Q8WW22 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAJA4Q8WW22 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJA4Q8WW22 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJA4Q8WW22 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJA4Q8WW22 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJA4Q8WW22 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJA4Q8WW22 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJA4Q8WW22 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJA4Q8WW22 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAJA4Q8WW22 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAJA4Q8WW22 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNAJA4Q8WW22 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNAJA4Q8WW22 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNAJA4Q8WW22 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNAJA4Q8WW22 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNAJA4Q8WW22 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNAJA4Q8WW22 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DNAJA4Q8WW22 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNAJA4Q8WW22 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNAJA4Q8WW22 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAJA4Q8WW22 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAJA4Q8WW22 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAJA4Q8WW22 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAJA4Q8WW22 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAJA4Q8WW22 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAJA4Q8WW22 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAJA4Q8WW22 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAJA4Q8WW22 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAJA4Q8WW22 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAJA4Q8WW22 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAJA4Q8WW22 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAJA4Q8WW22 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAJA4Q8WW22 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAJA4Q8WW22 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAJA4Q8WW22 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAJA4Q8WW22 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAJA4Q8WW22 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAJA4Q8WW22 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAJA4Q8WW22 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJA4Q8WW22 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJA4Q8WW22 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAJA4Q8WW22 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAJA4Q8WW22 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAJA4Q8WW22 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAJA4Q8WW22 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms