Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SVIPQ8NHG7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SVIPQ8NHG7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SVIPQ8NHG7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVIPQ8NHG7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVIPQ8NHG7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVIPQ8NHG7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVIPQ8NHG7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVIPQ8NHG7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVIPQ8NHG7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SVIPQ8NHG7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SVIPQ8NHG7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SVIPQ8NHG7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SVIPQ8NHG7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SVIPQ8NHG7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SVIPQ8NHG7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SVIPQ8NHG7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SVIPQ8NHG7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVIPQ8NHG7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVIPQ8NHG7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVIPQ8NHG7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SVIPQ8NHG7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SVIPQ8NHG7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SVIPQ8NHG7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SVIPQ8NHG7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SVIPQ8NHG7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SVIPQ8NHG7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SVIPQ8NHG7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVIPQ8NHG7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SVIPQ8NHG7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVIPQ8NHG7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SVIPQ8NHG7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SVIPQ8NHG7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SVIPQ8NHG7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SVIPQ8NHG7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVIPQ8NHG7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVIPQ8NHG7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVIPQ8NHG7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVIPQ8NHG7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVIPQ8NHG7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVIPQ8NHG7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SVIPQ8NHG7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVIPQ8NHG7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVIPQ8NHG7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVIPQ8NHG7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVIPQ8NHG7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVIPQ8NHG7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVIPQ8NHG7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVIPQ8NHG7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVIPQ8NHG7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVIPQ8NHG7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVIPQ8NHG7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVIPQ8NHG7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVIPQ8NHG7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVIPQ8NHG7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVIPQ8NHG7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVIPQ8NHG7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SVIPQ8NHG7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SVIPQ8NHG7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SVIPQ8NHG7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SVIPQ8NHG7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVIPQ8NHG7 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SVIPQ8NHG7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVIPQ8NHG7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVIPQ8NHG7 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVIPQ8NHG7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SVIPQ8NHG7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SVIPQ8NHG7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SVIPQ8NHG7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SVIPQ8NHG7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SVIPQ8NHG7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SVIPQ8NHG7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SVIPQ8NHG7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SVIPQ8NHG7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SVIPQ8NHG7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SVIPQ8NHG7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SVIPQ8NHG7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SVIPQ8NHG7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SVIPQ8NHG7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SVIPQ8NHG7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SVIPQ8NHG7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SVIPQ8NHG7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SVIPQ8NHG7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SVIPQ8NHG7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SVIPQ8NHG7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SVIPQ8NHG7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SVIPQ8NHG7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SVIPQ8NHG7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SVIPQ8NHG7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SVIPQ8NHG7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SVIPQ8NHG7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SVIPQ8NHG7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SVIPQ8NHG7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SVIPQ8NHG7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SVIPQ8NHG7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SVIPQ8NHG7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SVIPQ8NHG7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SVIPQ8NHG7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SVIPQ8NHG7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SVIPQ8NHG7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms