Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE00

TMEM104, Transmembrane protein 104, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM104Q8NE00 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM104Q8NE00 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM104Q8NE00 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM104Q8NE00 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM104Q8NE00 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM104Q8NE00 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM104Q8NE00 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM104Q8NE00 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM104Q8NE00 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM104Q8NE00 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM104Q8NE00 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM104Q8NE00 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM104Q8NE00 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM104Q8NE00 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM104Q8NE00 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM104Q8NE00 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM104Q8NE00 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM104Q8NE00 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM104Q8NE00 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM104Q8NE00 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM104Q8NE00 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM104Q8NE00 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM104Q8NE00 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM104Q8NE00 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM104Q8NE00 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM104Q8NE00 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM104Q8NE00 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM104Q8NE00 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM104Q8NE00 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM104Q8NE00 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM104Q8NE00 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM104Q8NE00 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM104Q8NE00 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM104Q8NE00 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM104Q8NE00 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM104Q8NE00 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM104Q8NE00 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM104Q8NE00 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM104Q8NE00 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM104Q8NE00 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM104Q8NE00 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM104Q8NE00 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM104Q8NE00 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM104Q8NE00 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM104Q8NE00 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM104Q8NE00 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM104Q8NE00 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM104Q8NE00 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM104Q8NE00 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM104Q8NE00 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM104Q8NE00 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM104Q8NE00 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM104Q8NE00 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM104Q8NE00 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM104Q8NE00 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM104Q8NE00 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM104Q8NE00 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM104Q8NE00 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM104Q8NE00 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM104Q8NE00 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM104Q8NE00 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM104Q8NE00 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM104Q8NE00 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM104Q8NE00 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM104Q8NE00 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM104Q8NE00 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM104Q8NE00 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM104Q8NE00 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM104Q8NE00 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM104Q8NE00 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM104Q8NE00 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM104Q8NE00 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM104Q8NE00 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM104Q8NE00 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM104Q8NE00 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM104Q8NE00 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM104Q8NE00 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM104Q8NE00 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM104Q8NE00 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM104Q8NE00 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM104Q8NE00 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM104Q8NE00 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM104Q8NE00 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM104Q8NE00 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM104Q8NE00 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM104Q8NE00 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM104Q8NE00 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM104Q8NE00 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM104Q8NE00 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM104Q8NE00 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM104Q8NE00 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM104Q8NE00 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM104Q8NE00 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM104Q8NE00 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM104Q8NE00 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM104Q8NE00 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM104Q8NE00 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM104Q8NE00 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM104Q8NE00 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM104Q8NE00 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms