Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HERC6Q8IVU3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HERC6Q8IVU3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HERC6Q8IVU3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HERC6Q8IVU3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HERC6Q8IVU3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HERC6Q8IVU3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HERC6Q8IVU3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HERC6Q8IVU3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HERC6Q8IVU3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HERC6Q8IVU3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HERC6Q8IVU3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HERC6Q8IVU3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HERC6Q8IVU3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HERC6Q8IVU3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HERC6Q8IVU3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HERC6Q8IVU3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HERC6Q8IVU3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HERC6Q8IVU3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HERC6Q8IVU3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
HERC6Q8IVU3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HERC6Q8IVU3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HERC6Q8IVU3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HERC6Q8IVU3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HERC6Q8IVU3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HERC6Q8IVU3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HERC6Q8IVU3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HERC6Q8IVU3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HERC6Q8IVU3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HERC6Q8IVU3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HERC6Q8IVU3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HERC6Q8IVU3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HERC6Q8IVU3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HERC6Q8IVU3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HERC6Q8IVU3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HERC6Q8IVU3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HERC6Q8IVU3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HERC6Q8IVU3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
HERC6Q8IVU3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
HERC6Q8IVU3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
HERC6Q8IVU3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
HERC6Q8IVU3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HERC6Q8IVU3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HERC6Q8IVU3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HERC6Q8IVU3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HERC6Q8IVU3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HERC6Q8IVU3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HERC6Q8IVU3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HERC6Q8IVU3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HERC6Q8IVU3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HERC6Q8IVU3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HERC6Q8IVU3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
HERC6Q8IVU3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HERC6Q8IVU3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HERC6Q8IVU3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HERC6Q8IVU3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HERC6Q8IVU3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HERC6Q8IVU3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HERC6Q8IVU3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HERC6Q8IVU3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HERC6Q8IVU3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HERC6Q8IVU3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HERC6Q8IVU3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HERC6Q8IVU3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HERC6Q8IVU3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HERC6Q8IVU3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HERC6Q8IVU3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HERC6Q8IVU3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
HERC6Q8IVU3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HERC6Q8IVU3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HERC6Q8IVU3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HERC6Q8IVU3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HERC6Q8IVU3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HERC6Q8IVU3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HERC6Q8IVU3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
HERC6Q8IVU3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HERC6Q8IVU3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HERC6Q8IVU3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HERC6Q8IVU3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HERC6Q8IVU3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HERC6Q8IVU3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HERC6Q8IVU3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HERC6Q8IVU3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HERC6Q8IVU3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HERC6Q8IVU3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HERC6Q8IVU3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HERC6Q8IVU3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HERC6Q8IVU3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HERC6Q8IVU3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HERC6Q8IVU3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HERC6Q8IVU3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
HERC6Q8IVU3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HERC6Q8IVU3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HERC6Q8IVU3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HERC6Q8IVU3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HERC6Q8IVU3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HERC6Q8IVU3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HERC6Q8IVU3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HERC6Q8IVU3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HERC6Q8IVU3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms