Protein–RNA interactions for Protein: Q86X55

CARM1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARM1Q86X55 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARM1Q86X55 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARM1Q86X55 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARM1Q86X55 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARM1Q86X55 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARM1Q86X55 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARM1Q86X55 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARM1Q86X55 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARM1Q86X55 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARM1Q86X55 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARM1Q86X55 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARM1Q86X55 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARM1Q86X55 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARM1Q86X55 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARM1Q86X55 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARM1Q86X55 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CARM1Q86X55 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CARM1Q86X55 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CARM1Q86X55 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARM1Q86X55 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARM1Q86X55 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARM1Q86X55 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARM1Q86X55 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARM1Q86X55 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARM1Q86X55 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARM1Q86X55 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARM1Q86X55 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARM1Q86X55 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARM1Q86X55 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARM1Q86X55 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARM1Q86X55 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARM1Q86X55 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARM1Q86X55 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CARM1Q86X55 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARM1Q86X55 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARM1Q86X55 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARM1Q86X55 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARM1Q86X55 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CARM1Q86X55 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARM1Q86X55 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARM1Q86X55 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARM1Q86X55 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CARM1Q86X55 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARM1Q86X55 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARM1Q86X55 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARM1Q86X55 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARM1Q86X55 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARM1Q86X55 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARM1Q86X55 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARM1Q86X55 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARM1Q86X55 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CARM1Q86X55 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CARM1Q86X55 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARM1Q86X55 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARM1Q86X55 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARM1Q86X55 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARM1Q86X55 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CARM1Q86X55 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARM1Q86X55 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARM1Q86X55 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARM1Q86X55 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARM1Q86X55 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARM1Q86X55 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CARM1Q86X55 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARM1Q86X55 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARM1Q86X55 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARM1Q86X55 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARM1Q86X55 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARM1Q86X55 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARM1Q86X55 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARM1Q86X55 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARM1Q86X55 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARM1Q86X55 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARM1Q86X55 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARM1Q86X55 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARM1Q86X55 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARM1Q86X55 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARM1Q86X55 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARM1Q86X55 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CARM1Q86X55 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARM1Q86X55 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARM1Q86X55 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARM1Q86X55 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARM1Q86X55 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARM1Q86X55 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARM1Q86X55 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARM1Q86X55 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARM1Q86X55 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CARM1Q86X55 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARM1Q86X55 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARM1Q86X55 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARM1Q86X55 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARM1Q86X55 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARM1Q86X55 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARM1Q86X55 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARM1Q86X55 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARM1Q86X55 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARM1Q86X55 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARM1Q86X55 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARM1Q86X55 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms