Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SKAP1Q86WV1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SKAP1Q86WV1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SKAP1Q86WV1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
SKAP1Q86WV1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SKAP1Q86WV1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SKAP1Q86WV1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SKAP1Q86WV1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SKAP1Q86WV1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
SKAP1Q86WV1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SKAP1Q86WV1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SKAP1Q86WV1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
SKAP1Q86WV1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SKAP1Q86WV1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SKAP1Q86WV1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SKAP1Q86WV1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SKAP1Q86WV1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SKAP1Q86WV1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SKAP1Q86WV1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SKAP1Q86WV1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SKAP1Q86WV1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SKAP1Q86WV1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SKAP1Q86WV1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SKAP1Q86WV1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SKAP1Q86WV1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SKAP1Q86WV1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SKAP1Q86WV1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SKAP1Q86WV1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SKAP1Q86WV1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SKAP1Q86WV1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SKAP1Q86WV1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SKAP1Q86WV1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SKAP1Q86WV1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SKAP1Q86WV1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SKAP1Q86WV1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SKAP1Q86WV1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SKAP1Q86WV1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SKAP1Q86WV1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SKAP1Q86WV1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SKAP1Q86WV1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SKAP1Q86WV1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SKAP1Q86WV1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SKAP1Q86WV1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SKAP1Q86WV1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SKAP1Q86WV1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
SKAP1Q86WV1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SKAP1Q86WV1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SKAP1Q86WV1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SKAP1Q86WV1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SKAP1Q86WV1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SKAP1Q86WV1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SKAP1Q86WV1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SKAP1Q86WV1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SKAP1Q86WV1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SKAP1Q86WV1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SKAP1Q86WV1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SKAP1Q86WV1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SKAP1Q86WV1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SKAP1Q86WV1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SKAP1Q86WV1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SKAP1Q86WV1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SKAP1Q86WV1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SKAP1Q86WV1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SKAP1Q86WV1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SKAP1Q86WV1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SKAP1Q86WV1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SKAP1Q86WV1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SKAP1Q86WV1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SKAP1Q86WV1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SKAP1Q86WV1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SKAP1Q86WV1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SKAP1Q86WV1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SKAP1Q86WV1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SKAP1Q86WV1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SKAP1Q86WV1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SKAP1Q86WV1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SKAP1Q86WV1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
SKAP1Q86WV1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SKAP1Q86WV1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SKAP1Q86WV1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SKAP1Q86WV1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SKAP1Q86WV1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SKAP1Q86WV1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SKAP1Q86WV1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SKAP1Q86WV1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SKAP1Q86WV1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SKAP1Q86WV1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SKAP1Q86WV1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SKAP1Q86WV1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SKAP1Q86WV1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SKAP1Q86WV1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SKAP1Q86WV1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SKAP1Q86WV1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SKAP1Q86WV1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SKAP1Q86WV1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SKAP1Q86WV1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SKAP1Q86WV1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SKAP1Q86WV1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SKAP1Q86WV1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SKAP1Q86WV1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms