Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALYREFQ86V81 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALYREFQ86V81 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALYREFQ86V81 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALYREFQ86V81 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALYREFQ86V81 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALYREFQ86V81 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALYREFQ86V81 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALYREFQ86V81 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALYREFQ86V81 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALYREFQ86V81 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALYREFQ86V81 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALYREFQ86V81 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALYREFQ86V81 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALYREFQ86V81 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ALYREFQ86V81 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALYREFQ86V81 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALYREFQ86V81 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALYREFQ86V81 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALYREFQ86V81 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALYREFQ86V81 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALYREFQ86V81 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ALYREFQ86V81 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ALYREFQ86V81 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALYREFQ86V81 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALYREFQ86V81 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALYREFQ86V81 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALYREFQ86V81 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALYREFQ86V81 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ALYREFQ86V81 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ALYREFQ86V81 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ALYREFQ86V81 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ALYREFQ86V81 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALYREFQ86V81 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALYREFQ86V81 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALYREFQ86V81 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALYREFQ86V81 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALYREFQ86V81 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ALYREFQ86V81 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALYREFQ86V81 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALYREFQ86V81 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALYREFQ86V81 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALYREFQ86V81 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALYREFQ86V81 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALYREFQ86V81 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALYREFQ86V81 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALYREFQ86V81 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALYREFQ86V81 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALYREFQ86V81 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALYREFQ86V81 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ALYREFQ86V81 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ALYREFQ86V81 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALYREFQ86V81 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALYREFQ86V81 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ALYREFQ86V81 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ALYREFQ86V81 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALYREFQ86V81 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ALYREFQ86V81 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALYREFQ86V81 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALYREFQ86V81 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALYREFQ86V81 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALYREFQ86V81 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALYREFQ86V81 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALYREFQ86V81 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALYREFQ86V81 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ALYREFQ86V81 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALYREFQ86V81 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALYREFQ86V81 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALYREFQ86V81 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALYREFQ86V81 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALYREFQ86V81 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALYREFQ86V81 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALYREFQ86V81 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALYREFQ86V81 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALYREFQ86V81 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ALYREFQ86V81 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALYREFQ86V81 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALYREFQ86V81 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALYREFQ86V81 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALYREFQ86V81 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALYREFQ86V81 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALYREFQ86V81 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALYREFQ86V81 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALYREFQ86V81 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALYREFQ86V81 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALYREFQ86V81 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALYREFQ86V81 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALYREFQ86V81 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALYREFQ86V81 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALYREFQ86V81 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALYREFQ86V81 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALYREFQ86V81 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALYREFQ86V81 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALYREFQ86V81 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALYREFQ86V81 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALYREFQ86V81 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALYREFQ86V81 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALYREFQ86V81 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALYREFQ86V81 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALYREFQ86V81 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms