Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP47Q6ZTR5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP47Q6ZTR5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP47Q6ZTR5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP47Q6ZTR5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP47Q6ZTR5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP47Q6ZTR5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP47Q6ZTR5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP47Q6ZTR5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP47Q6ZTR5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP47Q6ZTR5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP47Q6ZTR5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP47Q6ZTR5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP47Q6ZTR5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP47Q6ZTR5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP47Q6ZTR5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP47Q6ZTR5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP47Q6ZTR5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP47Q6ZTR5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP47Q6ZTR5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP47Q6ZTR5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP47Q6ZTR5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP47Q6ZTR5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP47Q6ZTR5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP47Q6ZTR5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP47Q6ZTR5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP47Q6ZTR5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP47Q6ZTR5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP47Q6ZTR5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP47Q6ZTR5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP47Q6ZTR5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP47Q6ZTR5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP47Q6ZTR5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP47Q6ZTR5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP47Q6ZTR5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP47Q6ZTR5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP47Q6ZTR5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP47Q6ZTR5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP47Q6ZTR5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP47Q6ZTR5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP47Q6ZTR5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CFAP47Q6ZTR5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP47Q6ZTR5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP47Q6ZTR5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP47Q6ZTR5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP47Q6ZTR5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms