Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EFCAB12Q6NXP0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EFCAB12Q6NXP0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EFCAB12Q6NXP0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EFCAB12Q6NXP0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EFCAB12Q6NXP0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EFCAB12Q6NXP0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EFCAB12Q6NXP0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EFCAB12Q6NXP0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EFCAB12Q6NXP0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EFCAB12Q6NXP0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EFCAB12Q6NXP0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EFCAB12Q6NXP0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EFCAB12Q6NXP0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EFCAB12Q6NXP0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EFCAB12Q6NXP0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EFCAB12Q6NXP0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
EFCAB12Q6NXP0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EFCAB12Q6NXP0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EFCAB12Q6NXP0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
EFCAB12Q6NXP0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EFCAB12Q6NXP0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EFCAB12Q6NXP0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EFCAB12Q6NXP0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EFCAB12Q6NXP0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EFCAB12Q6NXP0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EFCAB12Q6NXP0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EFCAB12Q6NXP0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
EFCAB12Q6NXP0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EFCAB12Q6NXP0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
EFCAB12Q6NXP0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EFCAB12Q6NXP0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EFCAB12Q6NXP0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EFCAB12Q6NXP0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EFCAB12Q6NXP0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EFCAB12Q6NXP0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EFCAB12Q6NXP0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EFCAB12Q6NXP0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EFCAB12Q6NXP0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EFCAB12Q6NXP0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EFCAB12Q6NXP0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EFCAB12Q6NXP0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EFCAB12Q6NXP0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EFCAB12Q6NXP0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EFCAB12Q6NXP0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
EFCAB12Q6NXP0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EFCAB12Q6NXP0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EFCAB12Q6NXP0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EFCAB12Q6NXP0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EFCAB12Q6NXP0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EFCAB12Q6NXP0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EFCAB12Q6NXP0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
EFCAB12Q6NXP0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
EFCAB12Q6NXP0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
EFCAB12Q6NXP0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
EFCAB12Q6NXP0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EFCAB12Q6NXP0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EFCAB12Q6NXP0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EFCAB12Q6NXP0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
EFCAB12Q6NXP0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EFCAB12Q6NXP0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EFCAB12Q6NXP0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EFCAB12Q6NXP0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EFCAB12Q6NXP0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
EFCAB12Q6NXP0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EFCAB12Q6NXP0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
EFCAB12Q6NXP0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
EFCAB12Q6NXP0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EFCAB12Q6NXP0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
EFCAB12Q6NXP0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EFCAB12Q6NXP0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EFCAB12Q6NXP0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EFCAB12Q6NXP0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
EFCAB12Q6NXP0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EFCAB12Q6NXP0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EFCAB12Q6NXP0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EFCAB12Q6NXP0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EFCAB12Q6NXP0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EFCAB12Q6NXP0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EFCAB12Q6NXP0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EFCAB12Q6NXP0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EFCAB12Q6NXP0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
EFCAB12Q6NXP0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
EFCAB12Q6NXP0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EFCAB12Q6NXP0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EFCAB12Q6NXP0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EFCAB12Q6NXP0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EFCAB12Q6NXP0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
EFCAB12Q6NXP0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EFCAB12Q6NXP0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EFCAB12Q6NXP0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EFCAB12Q6NXP0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EFCAB12Q6NXP0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EFCAB12Q6NXP0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EFCAB12Q6NXP0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EFCAB12Q6NXP0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EFCAB12Q6NXP0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EFCAB12Q6NXP0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
EFCAB12Q6NXP0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EFCAB12Q6NXP0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms