Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC8EQ6NSJ5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC8EQ6NSJ5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC8EQ6NSJ5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC8EQ6NSJ5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC8EQ6NSJ5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC8EQ6NSJ5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC8EQ6NSJ5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC8EQ6NSJ5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC8EQ6NSJ5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC8EQ6NSJ5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC8EQ6NSJ5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC8EQ6NSJ5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC8EQ6NSJ5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC8EQ6NSJ5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LRRC8EQ6NSJ5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC8EQ6NSJ5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC8EQ6NSJ5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC8EQ6NSJ5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC8EQ6NSJ5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC8EQ6NSJ5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC8EQ6NSJ5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC8EQ6NSJ5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC8EQ6NSJ5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC8EQ6NSJ5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC8EQ6NSJ5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC8EQ6NSJ5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC8EQ6NSJ5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC8EQ6NSJ5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC8EQ6NSJ5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC8EQ6NSJ5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC8EQ6NSJ5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC8EQ6NSJ5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC8EQ6NSJ5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC8EQ6NSJ5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC8EQ6NSJ5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC8EQ6NSJ5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC8EQ6NSJ5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC8EQ6NSJ5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC8EQ6NSJ5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC8EQ6NSJ5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC8EQ6NSJ5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC8EQ6NSJ5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC8EQ6NSJ5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC8EQ6NSJ5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC8EQ6NSJ5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC8EQ6NSJ5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC8EQ6NSJ5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC8EQ6NSJ5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC8EQ6NSJ5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC8EQ6NSJ5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC8EQ6NSJ5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC8EQ6NSJ5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC8EQ6NSJ5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC8EQ6NSJ5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC8EQ6NSJ5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC8EQ6NSJ5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC8EQ6NSJ5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC8EQ6NSJ5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC8EQ6NSJ5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC8EQ6NSJ5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC8EQ6NSJ5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC8EQ6NSJ5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC8EQ6NSJ5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC8EQ6NSJ5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC8EQ6NSJ5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC8EQ6NSJ5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC8EQ6NSJ5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC8EQ6NSJ5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC8EQ6NSJ5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC8EQ6NSJ5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC8EQ6NSJ5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC8EQ6NSJ5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC8EQ6NSJ5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC8EQ6NSJ5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC8EQ6NSJ5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC8EQ6NSJ5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC8EQ6NSJ5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC8EQ6NSJ5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC8EQ6NSJ5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC8EQ6NSJ5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC8EQ6NSJ5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC8EQ6NSJ5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC8EQ6NSJ5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC8EQ6NSJ5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC8EQ6NSJ5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC8EQ6NSJ5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC8EQ6NSJ5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC8EQ6NSJ5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC8EQ6NSJ5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC8EQ6NSJ5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC8EQ6NSJ5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC8EQ6NSJ5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC8EQ6NSJ5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC8EQ6NSJ5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC8EQ6NSJ5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC8EQ6NSJ5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms