Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ANKRD40Q6AI12 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ANKRD40Q6AI12 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ANKRD40Q6AI12 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ANKRD40Q6AI12 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ANKRD40Q6AI12 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ANKRD40Q6AI12 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ANKRD40Q6AI12 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ANKRD40Q6AI12 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ANKRD40Q6AI12 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ANKRD40Q6AI12 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ANKRD40Q6AI12 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ANKRD40Q6AI12 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ANKRD40Q6AI12 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ANKRD40Q6AI12 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ANKRD40Q6AI12 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ANKRD40Q6AI12 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ANKRD40Q6AI12 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ANKRD40Q6AI12 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ANKRD40Q6AI12 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ANKRD40Q6AI12 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ANKRD40Q6AI12 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ANKRD40Q6AI12 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ANKRD40Q6AI12 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ANKRD40Q6AI12 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ANKRD40Q6AI12 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ANKRD40Q6AI12 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ANKRD40Q6AI12 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ANKRD40Q6AI12 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ANKRD40Q6AI12 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ANKRD40Q6AI12 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ANKRD40Q6AI12 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ANKRD40Q6AI12 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ANKRD40Q6AI12 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ANKRD40Q6AI12 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ANKRD40Q6AI12 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ANKRD40Q6AI12 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ANKRD40Q6AI12 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ANKRD40Q6AI12 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ANKRD40Q6AI12 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ANKRD40Q6AI12 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ANKRD40Q6AI12 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ANKRD40Q6AI12 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ANKRD40Q6AI12 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ANKRD40Q6AI12 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ANKRD40Q6AI12 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ANKRD40Q6AI12 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ANKRD40Q6AI12 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ANKRD40Q6AI12 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ANKRD40Q6AI12 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ANKRD40Q6AI12 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ANKRD40Q6AI12 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ANKRD40Q6AI12 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ANKRD40Q6AI12 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ANKRD40Q6AI12 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ANKRD40Q6AI12 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ANKRD40Q6AI12 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ANKRD40Q6AI12 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ANKRD40Q6AI12 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ANKRD40Q6AI12 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ANKRD40Q6AI12 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ANKRD40Q6AI12 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ANKRD40Q6AI12 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ANKRD40Q6AI12 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ANKRD40Q6AI12 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ANKRD40Q6AI12 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ANKRD40Q6AI12 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ANKRD40Q6AI12 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ANKRD40Q6AI12 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ANKRD40Q6AI12 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ANKRD40Q6AI12 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ANKRD40Q6AI12 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ANKRD40Q6AI12 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ANKRD40Q6AI12 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ANKRD40Q6AI12 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ANKRD40Q6AI12 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ANKRD40Q6AI12 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ANKRD40Q6AI12 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ANKRD40Q6AI12 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ANKRD40Q6AI12 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ANKRD40Q6AI12 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ANKRD40Q6AI12 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ANKRD40Q6AI12 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ANKRD40Q6AI12 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ANKRD40Q6AI12 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ANKRD40Q6AI12 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ANKRD40Q6AI12 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ANKRD40Q6AI12 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ANKRD40Q6AI12 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ANKRD40Q6AI12 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ANKRD40Q6AI12 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ANKRD40Q6AI12 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ANKRD40Q6AI12 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ANKRD40Q6AI12 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ANKRD40Q6AI12 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ANKRD40Q6AI12 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ANKRD40Q6AI12 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ANKRD40Q6AI12 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ANKRD40Q6AI12 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ANKRD40Q6AI12 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms