Protein–RNA interactions for Protein: Q5TH69

ARFGEF3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF3Q5TH69 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARFGEF3Q5TH69 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFGEF3Q5TH69 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFGEF3Q5TH69 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFGEF3Q5TH69 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFGEF3Q5TH69 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARFGEF3Q5TH69 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFGEF3Q5TH69 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFGEF3Q5TH69 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFGEF3Q5TH69 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFGEF3Q5TH69 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFGEF3Q5TH69 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGEF3Q5TH69 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGEF3Q5TH69 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGEF3Q5TH69 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGEF3Q5TH69 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF3Q5TH69 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF3Q5TH69 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF3Q5TH69 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGEF3Q5TH69 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGEF3Q5TH69 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGEF3Q5TH69 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGEF3Q5TH69 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGEF3Q5TH69 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGEF3Q5TH69 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGEF3Q5TH69 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGEF3Q5TH69 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGEF3Q5TH69 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARFGEF3Q5TH69 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFGEF3Q5TH69 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFGEF3Q5TH69 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFGEF3Q5TH69 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF3Q5TH69 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF3Q5TH69 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF3Q5TH69 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF3Q5TH69 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF3Q5TH69 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF3Q5TH69 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF3Q5TH69 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF3Q5TH69 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF3Q5TH69 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF3Q5TH69 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF3Q5TH69 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF3Q5TH69 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF3Q5TH69 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGEF3Q5TH69 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGEF3Q5TH69 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARFGEF3Q5TH69 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARFGEF3Q5TH69 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARFGEF3Q5TH69 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARFGEF3Q5TH69 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARFGEF3Q5TH69 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARFGEF3Q5TH69 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARFGEF3Q5TH69 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARFGEF3Q5TH69 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGEF3Q5TH69 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGEF3Q5TH69 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGEF3Q5TH69 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGEF3Q5TH69 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGEF3Q5TH69 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGEF3Q5TH69 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGEF3Q5TH69 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF3Q5TH69 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF3Q5TH69 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF3Q5TH69 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF3Q5TH69 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF3Q5TH69 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF3Q5TH69 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF3Q5TH69 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGEF3Q5TH69 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGEF3Q5TH69 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGEF3Q5TH69 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGEF3Q5TH69 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGEF3Q5TH69 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGEF3Q5TH69 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGEF3Q5TH69 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGEF3Q5TH69 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGEF3Q5TH69 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ARFGEF3Q5TH69 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
ARFGEF3Q5TH69 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGEF3Q5TH69 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGEF3Q5TH69 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGEF3Q5TH69 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGEF3Q5TH69 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGEF3Q5TH69 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF3Q5TH69 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF3Q5TH69 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF3Q5TH69 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF3Q5TH69 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF3Q5TH69 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF3Q5TH69 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF3Q5TH69 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF3Q5TH69 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF3Q5TH69 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF3Q5TH69 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF3Q5TH69 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF3Q5TH69 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF3Q5TH69 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF3Q5TH69 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF3Q5TH69 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms