Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAMD5Q5TGI4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAMD5Q5TGI4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAMD5Q5TGI4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMD5Q5TGI4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMD5Q5TGI4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMD5Q5TGI4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMD5Q5TGI4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMD5Q5TGI4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMD5Q5TGI4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMD5Q5TGI4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMD5Q5TGI4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMD5Q5TGI4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMD5Q5TGI4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMD5Q5TGI4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMD5Q5TGI4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMD5Q5TGI4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMD5Q5TGI4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD5Q5TGI4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD5Q5TGI4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD5Q5TGI4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD5Q5TGI4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD5Q5TGI4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD5Q5TGI4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD5Q5TGI4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD5Q5TGI4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD5Q5TGI4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD5Q5TGI4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD5Q5TGI4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD5Q5TGI4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD5Q5TGI4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD5Q5TGI4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD5Q5TGI4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD5Q5TGI4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD5Q5TGI4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD5Q5TGI4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD5Q5TGI4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD5Q5TGI4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD5Q5TGI4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD5Q5TGI4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD5Q5TGI4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD5Q5TGI4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD5Q5TGI4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD5Q5TGI4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD5Q5TGI4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD5Q5TGI4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD5Q5TGI4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD5Q5TGI4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD5Q5TGI4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD5Q5TGI4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD5Q5TGI4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD5Q5TGI4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD5Q5TGI4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD5Q5TGI4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD5Q5TGI4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD5Q5TGI4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD5Q5TGI4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD5Q5TGI4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD5Q5TGI4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD5Q5TGI4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD5Q5TGI4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD5Q5TGI4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD5Q5TGI4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD5Q5TGI4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD5Q5TGI4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD5Q5TGI4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAMD5Q5TGI4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD5Q5TGI4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD5Q5TGI4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD5Q5TGI4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD5Q5TGI4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMD5Q5TGI4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMD5Q5TGI4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMD5Q5TGI4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAMD5Q5TGI4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAMD5Q5TGI4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAMD5Q5TGI4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SAMD5Q5TGI4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAMD5Q5TGI4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAMD5Q5TGI4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAMD5Q5TGI4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAMD5Q5TGI4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAMD5Q5TGI4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAMD5Q5TGI4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAMD5Q5TGI4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAMD5Q5TGI4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAMD5Q5TGI4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAMD5Q5TGI4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAMD5Q5TGI4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAMD5Q5TGI4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAMD5Q5TGI4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAMD5Q5TGI4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAMD5Q5TGI4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAMD5Q5TGI4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAMD5Q5TGI4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SAMD5Q5TGI4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SAMD5Q5TGI4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAMD5Q5TGI4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAMD5Q5TGI4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAMD5Q5TGI4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 966.9 ms