Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC23Q53EV4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC23Q53EV4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC23Q53EV4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC23Q53EV4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC23Q53EV4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC23Q53EV4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC23Q53EV4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC23Q53EV4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC23Q53EV4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC23Q53EV4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC23Q53EV4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC23Q53EV4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC23Q53EV4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC23Q53EV4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC23Q53EV4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC23Q53EV4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC23Q53EV4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC23Q53EV4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC23Q53EV4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC23Q53EV4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC23Q53EV4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC23Q53EV4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC23Q53EV4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC23Q53EV4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC23Q53EV4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC23Q53EV4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC23Q53EV4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC23Q53EV4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC23Q53EV4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC23Q53EV4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC23Q53EV4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC23Q53EV4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC23Q53EV4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC23Q53EV4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC23Q53EV4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC23Q53EV4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC23Q53EV4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC23Q53EV4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC23Q53EV4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC23Q53EV4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC23Q53EV4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC23Q53EV4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC23Q53EV4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC23Q53EV4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC23Q53EV4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC23Q53EV4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC23Q53EV4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC23Q53EV4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC23Q53EV4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC23Q53EV4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC23Q53EV4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC23Q53EV4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC23Q53EV4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC23Q53EV4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC23Q53EV4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC23Q53EV4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC23Q53EV4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC23Q53EV4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC23Q53EV4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC23Q53EV4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC23Q53EV4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC23Q53EV4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC23Q53EV4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC23Q53EV4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC23Q53EV4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC23Q53EV4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC23Q53EV4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC23Q53EV4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC23Q53EV4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC23Q53EV4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC23Q53EV4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC23Q53EV4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC23Q53EV4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC23Q53EV4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC23Q53EV4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC23Q53EV4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC23Q53EV4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC23Q53EV4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC23Q53EV4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC23Q53EV4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC23Q53EV4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC23Q53EV4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC23Q53EV4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC23Q53EV4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC23Q53EV4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC23Q53EV4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC23Q53EV4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC23Q53EV4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC23Q53EV4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC23Q53EV4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC23Q53EV4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC23Q53EV4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC23Q53EV4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC23Q53EV4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC23Q53EV4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC23Q53EV4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC23Q53EV4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC23Q53EV4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC23Q53EV4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms