Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX4Q33E94 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX4Q33E94 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX4Q33E94 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFX4Q33E94 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFX4Q33E94 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFX4Q33E94 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RFX4Q33E94 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX4Q33E94 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX4Q33E94 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFX4Q33E94 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFX4Q33E94 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RFX4Q33E94 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX4Q33E94 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX4Q33E94 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX4Q33E94 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX4Q33E94 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFX4Q33E94 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFX4Q33E94 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFX4Q33E94 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFX4Q33E94 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX4Q33E94 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX4Q33E94 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX4Q33E94 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX4Q33E94 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX4Q33E94 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX4Q33E94 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX4Q33E94 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX4Q33E94 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX4Q33E94 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX4Q33E94 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX4Q33E94 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX4Q33E94 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX4Q33E94 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX4Q33E94 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX4Q33E94 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX4Q33E94 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX4Q33E94 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX4Q33E94 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RFX4Q33E94 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX4Q33E94 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX4Q33E94 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX4Q33E94 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX4Q33E94 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX4Q33E94 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX4Q33E94 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX4Q33E94 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX4Q33E94 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX4Q33E94 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX4Q33E94 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX4Q33E94 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX4Q33E94 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX4Q33E94 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX4Q33E94 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX4Q33E94 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RFX4Q33E94 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX4Q33E94 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX4Q33E94 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX4Q33E94 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFX4Q33E94 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFX4Q33E94 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFX4Q33E94 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFX4Q33E94 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFX4Q33E94 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX4Q33E94 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX4Q33E94 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX4Q33E94 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX4Q33E94 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX4Q33E94 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX4Q33E94 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFX4Q33E94 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFX4Q33E94 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFX4Q33E94 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFX4Q33E94 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFX4Q33E94 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFX4Q33E94 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFX4Q33E94 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFX4Q33E94 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFX4Q33E94 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFX4Q33E94 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFX4Q33E94 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFX4Q33E94 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFX4Q33E94 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFX4Q33E94 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFX4Q33E94 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFX4Q33E94 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFX4Q33E94 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFX4Q33E94 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFX4Q33E94 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFX4Q33E94 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RFX4Q33E94 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFX4Q33E94 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFX4Q33E94 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFX4Q33E94 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFX4Q33E94 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFX4Q33E94 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFX4Q33E94 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFX4Q33E94 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFX4Q33E94 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFX4Q33E94 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms