Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ8

TMEM249, Transmembrane protein 249, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM249Q2WGJ8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM249Q2WGJ8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM249Q2WGJ8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM249Q2WGJ8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM249Q2WGJ8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM249Q2WGJ8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM249Q2WGJ8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM249Q2WGJ8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM249Q2WGJ8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM249Q2WGJ8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM249Q2WGJ8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM249Q2WGJ8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM249Q2WGJ8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM249Q2WGJ8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM249Q2WGJ8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM249Q2WGJ8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM249Q2WGJ8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM249Q2WGJ8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM249Q2WGJ8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM249Q2WGJ8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM249Q2WGJ8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM249Q2WGJ8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM249Q2WGJ8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM249Q2WGJ8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM249Q2WGJ8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM249Q2WGJ8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM249Q2WGJ8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM249Q2WGJ8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM249Q2WGJ8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM249Q2WGJ8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM249Q2WGJ8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM249Q2WGJ8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM249Q2WGJ8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM249Q2WGJ8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM249Q2WGJ8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM249Q2WGJ8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM249Q2WGJ8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM249Q2WGJ8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM249Q2WGJ8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM249Q2WGJ8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM249Q2WGJ8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM249Q2WGJ8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM249Q2WGJ8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM249Q2WGJ8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM249Q2WGJ8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM249Q2WGJ8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM249Q2WGJ8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM249Q2WGJ8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM249Q2WGJ8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM249Q2WGJ8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM249Q2WGJ8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM249Q2WGJ8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM249Q2WGJ8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM249Q2WGJ8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM249Q2WGJ8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM249Q2WGJ8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM249Q2WGJ8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM249Q2WGJ8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM249Q2WGJ8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM249Q2WGJ8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM249Q2WGJ8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM249Q2WGJ8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM249Q2WGJ8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM249Q2WGJ8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM249Q2WGJ8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM249Q2WGJ8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM249Q2WGJ8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM249Q2WGJ8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM249Q2WGJ8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM249Q2WGJ8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM249Q2WGJ8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM249Q2WGJ8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM249Q2WGJ8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM249Q2WGJ8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM249Q2WGJ8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM249Q2WGJ8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM249Q2WGJ8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM249Q2WGJ8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM249Q2WGJ8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM249Q2WGJ8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM249Q2WGJ8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM249Q2WGJ8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM249Q2WGJ8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM249Q2WGJ8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM249Q2WGJ8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM249Q2WGJ8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM249Q2WGJ8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM249Q2WGJ8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM249Q2WGJ8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM249Q2WGJ8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMEM249Q2WGJ8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM249Q2WGJ8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM249Q2WGJ8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM249Q2WGJ8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM249Q2WGJ8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM249Q2WGJ8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM249Q2WGJ8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM249Q2WGJ8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM249Q2WGJ8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM249Q2WGJ8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms