Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
KLHL40Q2TBA0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
KLHL40Q2TBA0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
KLHL40Q2TBA0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KLHL40Q2TBA0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
KLHL40Q2TBA0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
KLHL40Q2TBA0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
KLHL40Q2TBA0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
KLHL40Q2TBA0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
KLHL40Q2TBA0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
KLHL40Q2TBA0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
KLHL40Q2TBA0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
KLHL40Q2TBA0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
KLHL40Q2TBA0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
KLHL40Q2TBA0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
KLHL40Q2TBA0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
KLHL40Q2TBA0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
KLHL40Q2TBA0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KLHL40Q2TBA0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KLHL40Q2TBA0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KLHL40Q2TBA0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
KLHL40Q2TBA0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
KLHL40Q2TBA0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KLHL40Q2TBA0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KLHL40Q2TBA0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
KLHL40Q2TBA0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
KLHL40Q2TBA0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
KLHL40Q2TBA0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
KLHL40Q2TBA0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KLHL40Q2TBA0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KLHL40Q2TBA0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KLHL40Q2TBA0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KLHL40Q2TBA0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KLHL40Q2TBA0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
KLHL40Q2TBA0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
KLHL40Q2TBA0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
KLHL40Q2TBA0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
KLHL40Q2TBA0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
KLHL40Q2TBA0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
KLHL40Q2TBA0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
KLHL40Q2TBA0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
KLHL40Q2TBA0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
KLHL40Q2TBA0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
KLHL40Q2TBA0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KLHL40Q2TBA0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KLHL40Q2TBA0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KLHL40Q2TBA0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KLHL40Q2TBA0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
KLHL40Q2TBA0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KLHL40Q2TBA0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KLHL40Q2TBA0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KLHL40Q2TBA0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KLHL40Q2TBA0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KLHL40Q2TBA0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KLHL40Q2TBA0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
KLHL40Q2TBA0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KLHL40Q2TBA0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KLHL40Q2TBA0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
KLHL40Q2TBA0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
KLHL40Q2TBA0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KLHL40Q2TBA0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KLHL40Q2TBA0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
KLHL40Q2TBA0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KLHL40Q2TBA0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
KLHL40Q2TBA0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
KLHL40Q2TBA0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KLHL40Q2TBA0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KLHL40Q2TBA0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KLHL40Q2TBA0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KLHL40Q2TBA0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
KLHL40Q2TBA0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KLHL40Q2TBA0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KLHL40Q2TBA0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KLHL40Q2TBA0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KLHL40Q2TBA0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KLHL40Q2TBA0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
KLHL40Q2TBA0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
KLHL40Q2TBA0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
KLHL40Q2TBA0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
KLHL40Q2TBA0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
KLHL40Q2TBA0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
KLHL40Q2TBA0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KLHL40Q2TBA0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KLHL40Q2TBA0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KLHL40Q2TBA0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KLHL40Q2TBA0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KLHL40Q2TBA0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KLHL40Q2TBA0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KLHL40Q2TBA0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KLHL40Q2TBA0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KLHL40Q2TBA0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KLHL40Q2TBA0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KLHL40Q2TBA0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KLHL40Q2TBA0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KLHL40Q2TBA0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KLHL40Q2TBA0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KLHL40Q2TBA0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KLHL40Q2TBA0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KLHL40Q2TBA0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms