Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PSMD5Q16401 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PSMD5Q16401 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PSMD5Q16401 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSMD5Q16401 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMD5Q16401 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMD5Q16401 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMD5Q16401 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PSMD5Q16401 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMD5Q16401 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMD5Q16401 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMD5Q16401 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMD5Q16401 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMD5Q16401 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSMD5Q16401 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMD5Q16401 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMD5Q16401 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMD5Q16401 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMD5Q16401 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMD5Q16401 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMD5Q16401 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMD5Q16401 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSMD5Q16401 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSMD5Q16401 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSMD5Q16401 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSMD5Q16401 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSMD5Q16401 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSMD5Q16401 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMD5Q16401 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMD5Q16401 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMD5Q16401 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMD5Q16401 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMD5Q16401 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMD5Q16401 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMD5Q16401 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMD5Q16401 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMD5Q16401 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSMD5Q16401 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSMD5Q16401 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMD5Q16401 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMD5Q16401 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSMD5Q16401 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMD5Q16401 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PSMD5Q16401 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMD5Q16401 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMD5Q16401 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMD5Q16401 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMD5Q16401 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMD5Q16401 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMD5Q16401 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMD5Q16401 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMD5Q16401 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMD5Q16401 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMD5Q16401 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMD5Q16401 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMD5Q16401 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMD5Q16401 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMD5Q16401 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD5Q16401 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD5Q16401 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD5Q16401 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD5Q16401 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD5Q16401 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD5Q16401 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD5Q16401 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD5Q16401 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD5Q16401 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD5Q16401 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD5Q16401 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSMD5Q16401 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSMD5Q16401 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PSMD5Q16401 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMD5Q16401 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMD5Q16401 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMD5Q16401 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMD5Q16401 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMD5Q16401 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMD5Q16401 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMD5Q16401 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMD5Q16401 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMD5Q16401 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSMD5Q16401 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSMD5Q16401 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSMD5Q16401 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSMD5Q16401 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSMD5Q16401 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PSMD5Q16401 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMD5Q16401 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMD5Q16401 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMD5Q16401 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMD5Q16401 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMD5Q16401 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMD5Q16401 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMD5Q16401 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMD5Q16401 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMD5Q16401 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMD5Q16401 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMD5Q16401 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSMD5Q16401 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSMD5Q16401 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
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