Protein–RNA interactions for Protein: Q15424

SAFB, Scaffold attachment factor B1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAFBQ15424 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.973e-7■■■□□ 15.6
SAFBQ15424 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.973e-7■■■□□ 15.6
SAFBQ15424 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.973e-7■■■□□ 15.6
SAFBQ15424 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.443e-7■■■□□ 15.6
SAFBQ15424 MPC1-205ENST00000487218 918 ntTSL 56.94□□□□□ -1.33e-7■■■□□ 15.6
SAFBQ15424 MPC1-204ENST00000475708 651 ntTSL 52.56□□□□□ -23e-7■■■□□ 15.6
SAFBQ15424 HERC2P3-204ENST00000426501 5995 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.112e-6■■■□□ 15.5
SAFBQ15424 HERC2P3-205ENST00000428453 4383 ntTSL 212.68□□□□□ -0.382e-6■■■□□ 15.5
SAFBQ15424 HERC2P3-209ENST00000437318 4161 ntTSL 1 (best)9.59□□□□□ -0.872e-6■■■□□ 15.5
SAFBQ15424 MBNL2-206ENST00000469707 2574 ntTSL 1 (best)8.86□□□□□ -0.992e-7■■■□□ 15.4
SAFBQ15424 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.182e-7■■■□□ 15.4
SAFBQ15424 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.212e-7■■■□□ 15.4
SAFBQ15424 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.312e-7■■■□□ 15.4
SAFBQ15424 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.372e-7■■■□□ 15.4
SAFBQ15424 MBNL2-205ENST00000449284 581 ntTSL 26.18□□□□□ -1.422e-7■■■□□ 15.4
SAFBQ15424 APOL2-205ENST00000473549 579 ntTSL 415.87■□□□□ 0.138e-7■■■□□ 15.4
SAFBQ15424 APOL2-203ENST00000451256 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.098e-7■■■□□ 15.4
SAFBQ15424 APOL2-207ENST00000484830 527 ntTSL 414.98□□□□□ -0.018e-7■■■□□ 15.4
SAFBQ15424 APOL2-208ENST00000489186 579 ntTSL 312.68□□□□□ -0.388e-7■■■□□ 15.4
SAFBQ15424 APOL2-201ENST00000249066 2685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.588e-7■■■□□ 15.4
SAFBQ15424 APOL2-202ENST00000358502 2551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.718e-7■■■□□ 15.4
SAFBQ15424 APOL2-204ENST00000454728 577 ntTSL 49.98□□□□□ -0.818e-7■■■□□ 15.4
SAFBQ15424 RBMX-206ENST00000561733 837 ntTSL 311.84□□□□□ -0.514e-6■■■□□ 15.3
SAFBQ15424 RBMX-212ENST00000568578 4887 ntTSL 1 (best)11.34□□□□□ -0.594e-6■■■□□ 15.3
SAFBQ15424 RBMX-202ENST00000419968 940 ntTSL 510.34□□□□□ -0.754e-6■■■□□ 15.3
SAFBQ15424 RBMX-205ENST00000496459 2041 ntTSL 27.2□□□□□ -1.264e-6■■■□□ 15.3
SAFBQ15424 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.424e-6■■■□□ 15.3
SAFBQ15424 AC069277.1-203ENST00000414603 517 ntTSL 311.22□□□□□ -0.614e-8■■■□□ 15.2
SAFBQ15424 AC016723.1-202ENST00000436982 643 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.84e-6■■■□□ 15.2
SAFBQ15424 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.788e-7■■■□□ 15.2
SAFBQ15424 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.648e-7■■■□□ 15.2
SAFBQ15424 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.618e-7■■■□□ 15.2
SAFBQ15424 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.488e-7■■■□□ 15.2
SAFBQ15424 NMU-206ENST00000515325 616 ntTSL 36.63□□□□□ -1.358e-7■■■□□ 15.2
SAFBQ15424 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.77e-9■■■□□ 15.1
SAFBQ15424 FOXK2-202ENST00000473637 3462 ntTSL 1 (best)22.8■■□□□ 1.247e-9■■■□□ 15.1
SAFBQ15424 FOXK2-206ENST00000531030 805 ntTSL 320.49■□□□□ 0.877e-9■■■□□ 15.1
SAFBQ15424 FOXK2-203ENST00000526383 786 ntTSL 515.21■□□□□ 0.037e-9■■■□□ 15.1
SAFBQ15424 ZEB2-234ENST00000636413 8984 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.174e-6■■■□□ 15.1
SAFBQ15424 ZEB2-239ENST00000637045 9091 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.274e-6■■■□□ 15.1
SAFBQ15424 ZEB2-245ENST00000638087 9339 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.574e-6■■■□□ 15.1
SAFBQ15424 ZEB2-238ENST00000636820 9115 ntTSL 58.22□□□□□ -1.094e-6■■■□□ 15.1
SAFBQ15424 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.224e-6■■■□□ 15.1
SAFBQ15424 ELL2-206ENST00000513343 582 ntTSL 322.23■■□□□ 1.153e-7■■■□□ 15
SAFBQ15424 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.983e-7■■■□□ 15
SAFBQ15424 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.843e-6■■■□□ 15
SAFBQ15424 PRKCB-210ENST00000498739 569 ntTSL 419.05■□□□□ 0.643e-6■■■□□ 15
SAFBQ15424 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.283e-6■■■□□ 15
SAFBQ15424 RPH3AL-206ENST00000570954 568 ntTSL 414.1□□□□□ -0.158e-9■■■□□ 15
SAFBQ15424 RAPGEF5-201ENST00000344041 6621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -14e-6■■■□□ 15
SAFBQ15424 ATAD5-203ENST00000585133 2686 ntTSL 22.74□□□□□ -1.976e-6■■■□□ 15
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SAFBQ15424 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.542e-6■■■□□ 14.7
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SAFBQ15424 ARHGAP11B-206ENST00000566548 484 ntTSL 313.08□□□□□ -0.322e-6■■■□□ 14.7
SAFBQ15424 ARHGAP11B-202ENST00000562954 652 ntTSL 38.88□□□□□ -0.992e-6■■■□□ 14.7
SAFBQ15424 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.824e-6■■■□□ 14.6
SAFBQ15424 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.484e-6■■■□□ 14.6
SAFBQ15424 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.444e-6■■■□□ 14.6
SAFBQ15424 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.284e-6■■■□□ 14.6
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SAFBQ15424 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.171e-6■■■□□ 14.6
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SAFBQ15424 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.023e-6■■□□□ 14.5
SAFBQ15424 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.091e-6■■□□□ 14.5
SAFBQ15424 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.071e-6■■□□□ 14.5
SAFBQ15424 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.841e-6■■□□□ 14.5
SAFBQ15424 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.241e-6■■□□□ 14.5
SAFBQ15424 RTN4-211ENST00000438462 656 ntTSL 511.92□□□□□ -0.51e-6■■□□□ 14.5
SAFBQ15424 RTN4-206ENST00000394611 4161 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.791e-6■■□□□ 14.5
SAFBQ15424 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.131e-6■■□□□ 14.5
SAFBQ15424 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.71e-6■■□□□ 14.5
SAFBQ15424 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.721e-6■■□□□ 14.5
SAFBQ15424 PLCB1-220ENST00000630757 857 ntTSL 37.61□□□□□ -1.193e-6■■□□□ 14.4
SAFBQ15424 PLCB1-229ENST00000637204 100 ntTSL 53.15□□□□□ -1.913e-6■■□□□ 14.4
SAFBQ15424 IGF2BP3-206ENST00000468005 2948 ntTSL 516.15■□□□□ 0.182e-10■■□□□ 14.3
SAFBQ15424 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.637e-6■■□□□ 14.3
SAFBQ15424 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.737e-6■■□□□ 14.3
SAFBQ15424 GMDS-201ENST00000380805 1743 ntTSL 222.24■■□□□ 1.152e-6■■□□□ 14.2
SAFBQ15424 GMDS-209ENST00000531690 515 ntTSL 57.51□□□□□ -1.212e-6■■□□□ 14.2
SAFBQ15424 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.375e-6■■□□□ 14.2
SAFBQ15424 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.225e-6■■□□□ 14.2
SAFBQ15424 ZEB2-237ENST00000636732 5073 ntTSL 516.08■□□□□ 0.175e-6■■□□□ 14.2
SAFBQ15424 ZEB2-233ENST00000636179 8984 ntTSL 513.97□□□□□ -0.175e-6■■□□□ 14.2
SAFBQ15424 ZEB2-246ENST00000638128 8932 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.185e-6■■□□□ 14.2
SAFBQ15424 ZEB2-224ENST00000539609 4061 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.425e-6■■□□□ 14.2
SAFBQ15424 ZEB2-236ENST00000636471 9583 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.545e-6■■□□□ 14.2
SAFBQ15424 ZEB2-201ENST00000303660 3913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.725e-6■■□□□ 14.2
SAFBQ15424 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.885e-6■■□□□ 14.2
SAFBQ15424 ZEB2-205ENST00000419938 1755 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.895e-6■■□□□ 14.2
SAFBQ15424 ZEB2-210ENST00000440875 1809 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.95e-6■■□□□ 14.2
SAFBQ15424 ZEB2-232ENST00000636026 5172 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.935e-6■■□□□ 14.2
SAFBQ15424 ZEB2-206ENST00000427902 2236 ntTSL 1 (best)9.01□□□□□ -0.975e-6■■□□□ 14.2
SAFBQ15424 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.35e-6■■□□□ 14.2
SAFBQ15424 LINC00969-201ENST00000414625 729 ntTSL 517.97■□□□□ 0.472e-6■■□□□ 14.1
SAFBQ15424 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.152e-6■■□□□ 14.1
SAFBQ15424 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.122e-6■■□□□ 14.1
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