Protein–RNA interactions for Protein: Q15345

LRRC41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC41Q15345 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LRRC41Q15345 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LRRC41Q15345 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LRRC41Q15345 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
LRRC41Q15345 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
LRRC41Q15345 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
LRRC41Q15345 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
LRRC41Q15345 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRRC41Q15345 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRRC41Q15345 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LRRC41Q15345 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
LRRC41Q15345 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
LRRC41Q15345 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LRRC41Q15345 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRRC41Q15345 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LRRC41Q15345 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LRRC41Q15345 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LRRC41Q15345 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LRRC41Q15345 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LRRC41Q15345 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LRRC41Q15345 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LRRC41Q15345 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LRRC41Q15345 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LRRC41Q15345 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LRRC41Q15345 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LRRC41Q15345 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LRRC41Q15345 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRRC41Q15345 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRRC41Q15345 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRRC41Q15345 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRRC41Q15345 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRRC41Q15345 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRRC41Q15345 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LRRC41Q15345 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LRRC41Q15345 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LRRC41Q15345 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LRRC41Q15345 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LRRC41Q15345 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRC41Q15345 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRC41Q15345 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRC41Q15345 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRC41Q15345 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRC41Q15345 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRC41Q15345 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRC41Q15345 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRC41Q15345 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRC41Q15345 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRC41Q15345 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRC41Q15345 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRC41Q15345 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRC41Q15345 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRC41Q15345 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRC41Q15345 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRC41Q15345 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
LRRC41Q15345 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LRRC41Q15345 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LRRC41Q15345 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
LRRC41Q15345 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LRRC41Q15345 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRC41Q15345 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRC41Q15345 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LRRC41Q15345 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LRRC41Q15345 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LRRC41Q15345 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LRRC41Q15345 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LRRC41Q15345 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRC41Q15345 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRC41Q15345 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRC41Q15345 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRC41Q15345 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRC41Q15345 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRC41Q15345 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRC41Q15345 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRC41Q15345 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRC41Q15345 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRC41Q15345 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRC41Q15345 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRC41Q15345 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRC41Q15345 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRRC41Q15345 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRRC41Q15345 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LRRC41Q15345 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRC41Q15345 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRC41Q15345 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRC41Q15345 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRC41Q15345 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRC41Q15345 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRC41Q15345 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRC41Q15345 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRC41Q15345 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRC41Q15345 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRC41Q15345 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRC41Q15345 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRC41Q15345 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRC41Q15345 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRC41Q15345 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRC41Q15345 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRC41Q15345 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRC41Q15345 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRC41Q15345 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms