Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
PTPRKQ15262 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
PTPRKQ15262 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
PTPRKQ15262 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
PTPRKQ15262 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
PTPRKQ15262 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
PTPRKQ15262 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
PTPRKQ15262 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
PTPRKQ15262 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
PTPRKQ15262 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
PTPRKQ15262 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
PTPRKQ15262 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
PTPRKQ15262 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
PTPRKQ15262 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
PTPRKQ15262 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
PTPRKQ15262 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
PTPRKQ15262 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
PTPRKQ15262 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
PTPRKQ15262 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
PTPRKQ15262 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
PTPRKQ15262 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
PTPRKQ15262 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
PTPRKQ15262 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
PTPRKQ15262 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
PTPRKQ15262 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
PTPRKQ15262 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
PTPRKQ15262 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
PTPRKQ15262 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
PTPRKQ15262 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
PTPRKQ15262 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
PTPRKQ15262 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
PTPRKQ15262 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
PTPRKQ15262 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
PTPRKQ15262 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
PTPRKQ15262 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
PTPRKQ15262 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC40.03■■■■■ 4
PTPRKQ15262 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC40.03■■■■■ 4
PTPRKQ15262 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC40.03■■■■■ 4
PTPRKQ15262 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
PTPRKQ15262 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC40.01■■■■■ 4
PTPRKQ15262 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
PTPRKQ15262 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
PTPRKQ15262 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
PTPRKQ15262 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC40.01■■■■■ 4
PTPRKQ15262 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
PTPRKQ15262 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
PTPRKQ15262 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC40■■■■□ 3.99
PTPRKQ15262 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
PTPRKQ15262 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC40■■■■□ 3.99
PTPRKQ15262 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
PTPRKQ15262 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
PTPRKQ15262 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
PTPRKQ15262 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
PTPRKQ15262 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
PTPRKQ15262 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
PTPRKQ15262 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC39.94■■■■□ 3.98
PTPRKQ15262 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
PTPRKQ15262 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
PTPRKQ15262 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
PTPRKQ15262 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.92■■■■□ 3.98
PTPRKQ15262 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC39.9■■■■□ 3.98
PTPRKQ15262 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
PTPRKQ15262 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
PTPRKQ15262 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
PTPRKQ15262 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
PTPRKQ15262 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
PTPRKQ15262 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
PTPRKQ15262 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
PTPRKQ15262 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
PTPRKQ15262 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
PTPRKQ15262 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
PTPRKQ15262 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
PTPRKQ15262 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
PTPRKQ15262 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
PTPRKQ15262 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
PTPRKQ15262 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
PTPRKQ15262 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
PTPRKQ15262 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
PTPRKQ15262 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
PTPRKQ15262 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
PTPRKQ15262 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
PTPRKQ15262 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
PTPRKQ15262 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
PTPRKQ15262 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
PTPRKQ15262 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
PTPRKQ15262 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
PTPRKQ15262 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
PTPRKQ15262 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PTPRKQ15262 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PTPRKQ15262 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC39.73■■■■□ 3.95
PTPRKQ15262 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
PTPRKQ15262 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
PTPRKQ15262 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
PTPRKQ15262 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PTPRKQ15262 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PTPRKQ15262 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
PTPRKQ15262 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
PTPRKQ15262 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
PTPRKQ15262 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
PTPRKQ15262 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC39.67■■■■□ 3.94
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