Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRSF5Q13243 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRSF5Q13243 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRSF5Q13243 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRSF5Q13243 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRSF5Q13243 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRSF5Q13243 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRSF5Q13243 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRSF5Q13243 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SRSF5Q13243 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRSF5Q13243 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRSF5Q13243 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRSF5Q13243 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRSF5Q13243 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRSF5Q13243 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRSF5Q13243 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRSF5Q13243 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRSF5Q13243 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRSF5Q13243 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRSF5Q13243 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRSF5Q13243 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRSF5Q13243 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRSF5Q13243 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRSF5Q13243 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRSF5Q13243 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRSF5Q13243 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRSF5Q13243 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRSF5Q13243 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRSF5Q13243 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRSF5Q13243 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRSF5Q13243 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRSF5Q13243 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRSF5Q13243 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SRSF5Q13243 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRSF5Q13243 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRSF5Q13243 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRSF5Q13243 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRSF5Q13243 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRSF5Q13243 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRSF5Q13243 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRSF5Q13243 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRSF5Q13243 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRSF5Q13243 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRSF5Q13243 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRSF5Q13243 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRSF5Q13243 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRSF5Q13243 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRSF5Q13243 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRSF5Q13243 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRSF5Q13243 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRSF5Q13243 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRSF5Q13243 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRSF5Q13243 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SRSF5Q13243 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRSF5Q13243 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRSF5Q13243 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRSF5Q13243 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRSF5Q13243 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRSF5Q13243 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRSF5Q13243 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SRSF5Q13243 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRSF5Q13243 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRSF5Q13243 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRSF5Q13243 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRSF5Q13243 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRSF5Q13243 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRSF5Q13243 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRSF5Q13243 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRSF5Q13243 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRSF5Q13243 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRSF5Q13243 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRSF5Q13243 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRSF5Q13243 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRSF5Q13243 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRSF5Q13243 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SRSF5Q13243 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRSF5Q13243 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRSF5Q13243 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRSF5Q13243 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRSF5Q13243 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRSF5Q13243 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRSF5Q13243 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SRSF5Q13243 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SRSF5Q13243 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SRSF5Q13243 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRSF5Q13243 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRSF5Q13243 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRSF5Q13243 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRSF5Q13243 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRSF5Q13243 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SRSF5Q13243 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SRSF5Q13243 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SRSF5Q13243 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SRSF5Q13243 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SRSF5Q13243 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRSF5Q13243 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRSF5Q13243 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRSF5Q13243 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SRSF5Q13243 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SRSF5Q13243 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
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