Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIK3Q13003 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIK3Q13003 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIK3Q13003 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIK3Q13003 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
GRIK3Q13003 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
GRIK3Q13003 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIK3Q13003 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIK3Q13003 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIK3Q13003 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIK3Q13003 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIK3Q13003 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIK3Q13003 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIK3Q13003 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIK3Q13003 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIK3Q13003 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIK3Q13003 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIK3Q13003 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIK3Q13003 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIK3Q13003 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIK3Q13003 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIK3Q13003 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIK3Q13003 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIK3Q13003 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIK3Q13003 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIK3Q13003 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIK3Q13003 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIK3Q13003 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIK3Q13003 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIK3Q13003 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIK3Q13003 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIK3Q13003 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIK3Q13003 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIK3Q13003 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIK3Q13003 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIK3Q13003 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIK3Q13003 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIK3Q13003 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIK3Q13003 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIK3Q13003 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIK3Q13003 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIK3Q13003 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIK3Q13003 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIK3Q13003 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIK3Q13003 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIK3Q13003 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIK3Q13003 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIK3Q13003 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIK3Q13003 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIK3Q13003 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIK3Q13003 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIK3Q13003 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIK3Q13003 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIK3Q13003 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIK3Q13003 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIK3Q13003 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIK3Q13003 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIK3Q13003 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIK3Q13003 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIK3Q13003 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIK3Q13003 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIK3Q13003 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIK3Q13003 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIK3Q13003 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIK3Q13003 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIK3Q13003 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIK3Q13003 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GRIK3Q13003 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GRIK3Q13003 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIK3Q13003 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIK3Q13003 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIK3Q13003 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIK3Q13003 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIK3Q13003 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIK3Q13003 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIK3Q13003 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIK3Q13003 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIK3Q13003 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIK3Q13003 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIK3Q13003 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIK3Q13003 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIK3Q13003 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIK3Q13003 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIK3Q13003 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIK3Q13003 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIK3Q13003 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIK3Q13003 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIK3Q13003 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIK3Q13003 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIK3Q13003 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIK3Q13003 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIK3Q13003 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIK3Q13003 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIK3Q13003 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIK3Q13003 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIK3Q13003 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIK3Q13003 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIK3Q13003 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIK3Q13003 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIK3Q13003 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms