Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCB1Q12824 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCB1Q12824 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMARCB1Q12824 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCB1Q12824 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCB1Q12824 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCB1Q12824 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCB1Q12824 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCB1Q12824 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCB1Q12824 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCB1Q12824 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCB1Q12824 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCB1Q12824 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCB1Q12824 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCB1Q12824 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCB1Q12824 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCB1Q12824 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCB1Q12824 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCB1Q12824 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCB1Q12824 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCB1Q12824 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCB1Q12824 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCB1Q12824 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCB1Q12824 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCB1Q12824 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCB1Q12824 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCB1Q12824 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCB1Q12824 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCB1Q12824 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCB1Q12824 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCB1Q12824 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMARCB1Q12824 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCB1Q12824 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCB1Q12824 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCB1Q12824 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCB1Q12824 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCB1Q12824 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCB1Q12824 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCB1Q12824 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCB1Q12824 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCB1Q12824 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCB1Q12824 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCB1Q12824 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCB1Q12824 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCB1Q12824 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCB1Q12824 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCB1Q12824 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCB1Q12824 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCB1Q12824 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCB1Q12824 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCB1Q12824 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCB1Q12824 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCB1Q12824 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCB1Q12824 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMARCB1Q12824 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCB1Q12824 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCB1Q12824 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCB1Q12824 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCB1Q12824 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCB1Q12824 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCB1Q12824 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCB1Q12824 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCB1Q12824 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCB1Q12824 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCB1Q12824 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCB1Q12824 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCB1Q12824 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCB1Q12824 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCB1Q12824 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCB1Q12824 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCB1Q12824 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCB1Q12824 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCB1Q12824 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCB1Q12824 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCB1Q12824 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCB1Q12824 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCB1Q12824 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCB1Q12824 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCB1Q12824 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCB1Q12824 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCB1Q12824 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCB1Q12824 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCB1Q12824 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCB1Q12824 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCB1Q12824 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCB1Q12824 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCB1Q12824 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCB1Q12824 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCB1Q12824 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCB1Q12824 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCB1Q12824 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCB1Q12824 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCB1Q12824 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCB1Q12824 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCB1Q12824 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCB1Q12824 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCB1Q12824 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCB1Q12824 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCB1Q12824 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCB1Q12824 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
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