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Protein–RNA interactions for Protein: Q12241
VAM3, Syntaxin VAM3, yeast
Predictions only
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283 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
VAM3
Q12241
MDM35
YKL053C-A
261 nt
7.7
□□□□□ -1.18
VAM3
Q12241
RAS2
YNL098C
969 nt
7.7
□□□□□ -1.18
VAM3
Q12241
THI6
YPL214C
1623 nt
7.7
□□□□□ -1.18
VAM3
Q12241
YHR218W
YHR218W
1812 nt
7.69
□□□□□ -1.18
VAM3
Q12241
YHR219W
YHR219W
1875 nt
7.69
□□□□□ -1.18
VAM3
Q12241
YPI1
YFR003C
468 nt
7.68
□□□□□ -1.18
VAM3
Q12241
ASP3-1
YLR155C
1089 nt
7.68
□□□□□ -1.18
VAM3
Q12241
ASP3-2
YLR157C
1089 nt
7.68
□□□□□ -1.18
VAM3
Q12241
ASP3-3
YLR158C
1089 nt
7.68
□□□□□ -1.18
VAM3
Q12241
ASP3-4
YLR160C
1089 nt
7.68
□□□□□ -1.18
VAM3
Q12241
GPN2
YOR262W
1044 nt
7.68
□□□□□ -1.18
VAM3
Q12241
LSB3
YFR024C-A
1380 nt
7.68
□□□□□ -1.18
VAM3
Q12241
SOL2
YCR073W-A
948 nt
7.67
□□□□□ -1.18
VAM3
Q12241
LSB5
YCL034W
1065 nt
7.67
□□□□□ -1.18
VAM3
Q12241
RPD3
YNL330C
1302 nt
7.67
□□□□□ -1.18
VAM3
Q12241
DLD3
YEL071W
1491 nt
7.67
□□□□□ -1.18
VAM3
Q12241
TIM44
YIL022W
1296 nt
7.66
□□□□□ -1.18
VAM3
Q12241
HXT12
YIL170W
1374 nt
7.66
□□□□□ -1.18
VAM3
Q12241
GCD11
YER025W
1584 nt
7.66
□□□□□ -1.18
VAM3
Q12241
MDL2
YPL270W
2322 nt
7.66
□□□□□ -1.18
VAM3
Q12241
TAT2
YOL020W
1779 nt
7.65
□□□□□ -1.18
VAM3
Q12241
LSR1
LSR1
1175 nt
7.64
□□□□□ -1.19
VAM3
Q12241
MET8
YBR213W
825 nt
7.63
□□□□□ -1.19
VAM3
Q12241
VRG4
YGL225W
1014 nt
7.62
□□□□□ -1.19
VAM3
Q12241
SNU66
YOR308C
1764 nt
7.61
□□□□□ -1.19
VAM3
Q12241
RPT5
YOR117W
1305 nt
7.61
□□□□□ -1.19
VAM3
Q12241
HXT10
YFL011W
1641 nt
7.61
□□□□□ -1.19
VAM3
Q12241
OYE2
YHR179W
1203 nt
7.61
□□□□□ -1.19
VAM3
Q12241
KRR1
YCL059C
951 nt
7.6
□□□□□ -1.19
VAM3
Q12241
YMR262W
YMR262W
942 nt
7.6
□□□□□ -1.19
VAM3
Q12241
YNR029C
YNR029C
1290 nt
7.6
□□□□□ -1.19
VAM3
Q12241
VMA11
YPL234C
495 nt
7.6
□□□□□ -1.19
VAM3
Q12241
EAF3
YPR023C
1206 nt
7.6
□□□□□ -1.19
VAM3
Q12241
SAM3
YPL274W
1764 nt
7.6
□□□□□ -1.19
VAM3
Q12241
ADE2
YOR128C
1716 nt
7.59
□□□□□ -1.19
VAM3
Q12241
YJL118W
YJL118W
660 nt
7.59
□□□□□ -1.19
VAM3
Q12241
YJL055W
YJL055W
738 nt
7.58
□□□□□ -1.2
VAM3
Q12241
ADH1
YOL086C
1047 nt
7.58
□□□□□ -1.2
VAM3
Q12241
TIP1
YBR067C
633 nt
7.58
□□□□□ -1.2
VAM3
Q12241
RIB2
YOL066C
1776 nt
7.58
□□□□□ -1.2
VAM3
Q12241
ADE5,7
YGL234W
2409 nt
7.58
□□□□□ -1.2
VAM3
Q12241
ITR2
YOL103W
1830 nt
7.57
□□□□□ -1.2
VAM3
Q12241
LSM5
YER146W
282 nt
7.56
□□□□□ -1.2
VAM3
Q12241
RIB7
YBR153W
735 nt
7.56
□□□□□ -1.2
VAM3
Q12241
YDR455C
YDR455C
309 nt
7.55
□□□□□ -1.2
VAM3
Q12241
MAM3
YOL060C
2121 nt
7.54
□□□□□ -1.2
VAM3
Q12241
RPC31
YNL151C
756 nt
7.54
□□□□□ -1.2
VAM3
Q12241
AGP3
YFL055W
1677 nt
7.54
□□□□□ -1.2
VAM3
Q12241
PCP1
YGR101W
1041 nt
7.53
□□□□□ -1.2
VAM3
Q12241
SNX3
YOR357C
489 nt
7.53
□□□□□ -1.2
VAM3
Q12241
RIM2
YBR192W
1134 nt
7.53
□□□□□ -1.2
VAM3
Q12241
ERG13
YML126C
1476 nt
7.53
□□□□□ -1.2
VAM3
Q12241
TPS1
YBR126C
1488 nt
7.53
□□□□□ -1.2
VAM3
Q12241
GAL3
YDR009W
1563 nt
7.53
□□□□□ -1.2
VAM3
Q12241
ECM10
YEL030W
1935 nt
7.52
□□□□□ -1.2
VAM3
Q12241
INH1
YDL181W
258 nt
7.52
□□□□□ -1.21
VAM3
Q12241
YJL195C
YJL195C
702 nt
7.5
□□□□□ -1.21
VAM3
Q12241
NBA1
YOL070C
1506 nt
7.5
□□□□□ -1.21
VAM3
Q12241
DDI1
YER143W
1287 nt
7.49
□□□□□ -1.21
VAM3
Q12241
YOR072W
YOR072W
315 nt
7.49
□□□□□ -1.21
VAM3
Q12241
TMA23
YMR269W
636 nt
7.48
□□□□□ -1.21
VAM3
Q12241
RRT8
YOL048C
1029 nt
7.48
□□□□□ -1.21
VAM3
Q12241
SAC7
YDR389W
1965 nt
7.48
□□□□□ -1.21
VAM3
Q12241
LPD1
YFL018C
1500 nt
7.47
□□□□□ -1.21
VAM3
Q12241
DPL1
YDR294C
1770 nt
7.47
□□□□□ -1.21
VAM3
Q12241
FUN14
YAL008W
597 nt
7.46
□□□□□ -1.22
VAM3
Q12241
PAB1
YER165W
1734 nt
7.46
□□□□□ -1.22
VAM3
Q12241
YMR265C
YMR265C
1386 nt
7.46
□□□□□ -1.22
VAM3
Q12241
RPN14
YGL004C
1254 nt
7.45
□□□□□ -1.22
VAM3
Q12241
IMO32
YGR031W
1029 nt
7.44
□□□□□ -1.22
VAM3
Q12241
LEU4
YNL104C
1860 nt
7.44
□□□□□ -1.22
VAM3
Q12241
YNR064C
YNR064C
873 nt
7.43
□□□□□ -1.22
VAM3
Q12241
CCT5
YJR064W
1689 nt
7.43
□□□□□ -1.22
VAM3
Q12241
ELO1
YJL196C
933 nt
7.42
□□□□□ -1.22
VAM3
Q12241
HAP5
YOR358W
729 nt
7.42
□□□□□ -1.22
VAM3
Q12241
YIL177C
YIL177C
5277 nt
7.42
□□□□□ -1.22
VAM3
Q12241
ADE8
YDR408C
645 nt
7.41
□□□□□ -1.22
VAM3
Q12241
YEL008W
YEL008W
381 nt
7.41
□□□□□ -1.22
VAM3
Q12241
YJR114W
YJR114W
393 nt
7.41
□□□□□ -1.22
VAM3
Q12241
DAK2
YFL053W
1776 nt
7.41
□□□□□ -1.22
VAM3
Q12241
KEL3
YPL263C
1956 nt
7.39
□□□□□ -1.23
VAM3
Q12241
YDR467C
YDR467C
327 nt
7.39
□□□□□ -1.23
VAM3
Q12241
NAS6
YGR232W
687 nt
7.39
□□□□□ -1.23
VAM3
Q12241
YPR126C
YPR126C
309 nt
7.38
□□□□□ -1.23
VAM3
Q12241
SNZ1
YMR096W
894 nt
7.37
□□□□□ -1.23
VAM3
Q12241
YEL023C
YEL023C
2049 nt
7.37
□□□□□ -1.23
VAM3
Q12241
NPP2
YEL016C
1482 nt
7.36
□□□□□ -1.23
VAM3
Q12241
YRF1-3
YGR296W
5580 nt
7.36
□□□□□ -1.23
VAM3
Q12241
YRF1-6
YNL339C
5580 nt
7.36
□□□□□ -1.23
VAM3
Q12241
YRF1-7
YPL283C
5580 nt
7.36
□□□□□ -1.23
VAM3
Q12241
SUV3
YPL029W
2214 nt
7.36
□□□□□ -1.23
VAM3
Q12241
tE(CUC)D
tE(CUC)D
72 nt
7.36
□□□□□ -1.23
VAM3
Q12241
tE(CUC)I
tE(CUC)I
72 nt
7.36
□□□□□ -1.23
VAM3
Q12241
snR31
snR31
225 nt
7.36
□□□□□ -1.23
VAM3
Q12241
STE4
YOR212W
1272 nt
7.35
□□□□□ -1.23
VAM3
Q12241
MEX67
YPL169C
1800 nt
7.34
□□□□□ -1.23
VAM3
Q12241
tD(GUC)B
tD(GUC)B
72 nt
7.34
□□□□□ -1.23
VAM3
Q12241
tD(GUC)D
tD(GUC)D
72 nt
7.34
□□□□□ -1.23
VAM3
Q12241
tD(GUC)G1
tD(GUC)G1
72 nt
7.34
□□□□□ -1.23
VAM3
Q12241
tD(GUC)G2
tD(GUC)G2
72 nt
7.34
□□□□□ -1.23
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