Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
CPSF1Q10570 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
CPSF1Q10570 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CPSF1Q10570 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CPSF1Q10570 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CPSF1Q10570 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CPSF1Q10570 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CPSF1Q10570 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CPSF1Q10570 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CPSF1Q10570 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
CPSF1Q10570 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CPSF1Q10570 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CPSF1Q10570 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CPSF1Q10570 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
CPSF1Q10570 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CPSF1Q10570 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CPSF1Q10570 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CPSF1Q10570 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CPSF1Q10570 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CPSF1Q10570 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CPSF1Q10570 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CPSF1Q10570 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CPSF1Q10570 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CPSF1Q10570 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CPSF1Q10570 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CPSF1Q10570 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CPSF1Q10570 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CPSF1Q10570 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CPSF1Q10570 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CPSF1Q10570 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CPSF1Q10570 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CPSF1Q10570 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CPSF1Q10570 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
CPSF1Q10570 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CPSF1Q10570 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CPSF1Q10570 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CPSF1Q10570 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CPSF1Q10570 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CPSF1Q10570 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CPSF1Q10570 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CPSF1Q10570 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CPSF1Q10570 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CPSF1Q10570 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
CPSF1Q10570 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CPSF1Q10570 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CPSF1Q10570 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CPSF1Q10570 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CPSF1Q10570 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CPSF1Q10570 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
CPSF1Q10570 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
CPSF1Q10570 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
CPSF1Q10570 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
CPSF1Q10570 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
CPSF1Q10570 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
CPSF1Q10570 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
CPSF1Q10570 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
CPSF1Q10570 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
CPSF1Q10570 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
CPSF1Q10570 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CPSF1Q10570 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CPSF1Q10570 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CPSF1Q10570 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CPSF1Q10570 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CPSF1Q10570 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CPSF1Q10570 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CPSF1Q10570 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CPSF1Q10570 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CPSF1Q10570 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CPSF1Q10570 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CPSF1Q10570 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CPSF1Q10570 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CPSF1Q10570 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CPSF1Q10570 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CPSF1Q10570 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CPSF1Q10570 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CPSF1Q10570 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CPSF1Q10570 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CPSF1Q10570 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CPSF1Q10570 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CPSF1Q10570 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
CPSF1Q10570 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CPSF1Q10570 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CPSF1Q10570 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CPSF1Q10570 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CPSF1Q10570 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CPSF1Q10570 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CPSF1Q10570 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CPSF1Q10570 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CPSF1Q10570 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CPSF1Q10570 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CPSF1Q10570 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CPSF1Q10570 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CPSF1Q10570 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CPSF1Q10570 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CPSF1Q10570 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CPSF1Q10570 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CPSF1Q10570 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CPSF1Q10570 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CPSF1Q10570 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CPSF1Q10570 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
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