Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DSC1Q08554 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
DSC1Q08554 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DSC1Q08554 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DSC1Q08554 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DSC1Q08554 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DSC1Q08554 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
DSC1Q08554 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
DSC1Q08554 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
DSC1Q08554 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DSC1Q08554 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DSC1Q08554 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DSC1Q08554 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DSC1Q08554 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
DSC1Q08554 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
DSC1Q08554 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
DSC1Q08554 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DSC1Q08554 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
DSC1Q08554 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DSC1Q08554 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DSC1Q08554 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DSC1Q08554 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DSC1Q08554 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DSC1Q08554 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
DSC1Q08554 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DSC1Q08554 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DSC1Q08554 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
DSC1Q08554 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
DSC1Q08554 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DSC1Q08554 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DSC1Q08554 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DSC1Q08554 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DSC1Q08554 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DSC1Q08554 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DSC1Q08554 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DSC1Q08554 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DSC1Q08554 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DSC1Q08554 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DSC1Q08554 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DSC1Q08554 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DSC1Q08554 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DSC1Q08554 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DSC1Q08554 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DSC1Q08554 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DSC1Q08554 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DSC1Q08554 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DSC1Q08554 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DSC1Q08554 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DSC1Q08554 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DSC1Q08554 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DSC1Q08554 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
DSC1Q08554 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DSC1Q08554 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DSC1Q08554 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DSC1Q08554 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DSC1Q08554 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DSC1Q08554 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DSC1Q08554 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DSC1Q08554 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DSC1Q08554 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
DSC1Q08554 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DSC1Q08554 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
DSC1Q08554 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
DSC1Q08554 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
DSC1Q08554 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
DSC1Q08554 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
DSC1Q08554 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
DSC1Q08554 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
DSC1Q08554 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
DSC1Q08554 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DSC1Q08554 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DSC1Q08554 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DSC1Q08554 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DSC1Q08554 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DSC1Q08554 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DSC1Q08554 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DSC1Q08554 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DSC1Q08554 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DSC1Q08554 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DSC1Q08554 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DSC1Q08554 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DSC1Q08554 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DSC1Q08554 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DSC1Q08554 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DSC1Q08554 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DSC1Q08554 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
DSC1Q08554 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DSC1Q08554 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
DSC1Q08554 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DSC1Q08554 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DSC1Q08554 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DSC1Q08554 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DSC1Q08554 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DSC1Q08554 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DSC1Q08554 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DSC1Q08554 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DSC1Q08554 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DSC1Q08554 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DSC1Q08554 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DSC1Q08554 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms