Protein–RNA interactions for Protein: Q07020

RPL18, 60S ribosomal protein L18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18Q07020 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL18Q07020 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL18Q07020 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL18Q07020 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL18Q07020 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL18Q07020 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL18Q07020 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL18Q07020 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL18Q07020 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL18Q07020 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL18Q07020 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL18Q07020 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL18Q07020 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL18Q07020 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL18Q07020 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL18Q07020 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL18Q07020 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL18Q07020 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL18Q07020 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL18Q07020 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL18Q07020 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL18Q07020 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL18Q07020 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL18Q07020 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL18Q07020 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL18Q07020 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL18Q07020 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL18Q07020 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL18Q07020 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL18Q07020 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL18Q07020 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL18Q07020 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL18Q07020 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL18Q07020 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL18Q07020 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL18Q07020 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL18Q07020 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL18Q07020 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL18Q07020 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RPL18Q07020 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL18Q07020 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL18Q07020 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL18Q07020 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL18Q07020 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL18Q07020 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL18Q07020 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL18Q07020 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL18Q07020 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL18Q07020 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL18Q07020 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL18Q07020 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL18Q07020 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL18Q07020 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL18Q07020 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL18Q07020 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL18Q07020 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL18Q07020 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPL18Q07020 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL18Q07020 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL18Q07020 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL18Q07020 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL18Q07020 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL18Q07020 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL18Q07020 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL18Q07020 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL18Q07020 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL18Q07020 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL18Q07020 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL18Q07020 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL18Q07020 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL18Q07020 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL18Q07020 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL18Q07020 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL18Q07020 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL18Q07020 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL18Q07020 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL18Q07020 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL18Q07020 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL18Q07020 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL18Q07020 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPL18Q07020 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPL18Q07020 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL18Q07020 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL18Q07020 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL18Q07020 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL18Q07020 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL18Q07020 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL18Q07020 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL18Q07020 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL18Q07020 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL18Q07020 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPL18Q07020 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPL18Q07020 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL18Q07020 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL18Q07020 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL18Q07020 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL18Q07020 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL18Q07020 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL18Q07020 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL18Q07020 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms