Protein–RNA interactions for Protein: Q04006

UPS3, Protein UPS3, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UPS3Q04006 YLR173WYLR173W 1827 nt7.04□□□□□ -1.28
UPS3Q04006 NUC1YJL208C 990 nt7.03□□□□□ -1.28
UPS3Q04006 FET5YFL041W 1869 nt7.02□□□□□ -1.28
UPS3Q04006 PMA2YPL036W 2844 nt7.02□□□□□ -1.29
UPS3Q04006 YGR012WYGR012W 1182 nt7.02□□□□□ -1.29
UPS3Q04006 TIM44YIL022W 1296 nt7.02□□□□□ -1.29
UPS3Q04006 BNI5YNL166C 1347 nt7.01□□□□□ -1.29
UPS3Q04006 POP2YNR052C 1302 nt7.01□□□□□ -1.29
UPS3Q04006 MSC1YML128C 1542 nt7.01□□□□□ -1.29
UPS3Q04006 GCD11YER025W 1584 nt7.01□□□□□ -1.29
UPS3Q04006 ENT4YLL038C 744 nt7.01□□□□□ -1.29
UPS3Q04006 ECM10YEL030W 1935 nt7□□□□□ -1.29
UPS3Q04006 YHR219WYHR219W 1875 nt7□□□□□ -1.29
UPS3Q04006 FCY21YER060W 1587 nt6.99□□□□□ -1.29
UPS3Q04006 FRT1YOR324C 1809 nt6.99□□□□□ -1.29
UPS3Q04006 FUB1YCR076C 753 nt6.98□□□□□ -1.29
UPS3Q04006 YLR046CYLR046C 813 nt6.98□□□□□ -1.29
UPS3Q04006 RAS2YNL098C 969 nt6.98□□□□□ -1.29
UPS3Q04006 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt6.98□□□□□ -1.29
UPS3Q04006 RPD3YNL330C 1302 nt6.98□□□□□ -1.29
UPS3Q04006 MSB4YOL112W 1479 nt6.98□□□□□ -1.29
UPS3Q04006 HEM13YDR044W 987 nt6.97□□□□□ -1.29
UPS3Q04006 LSM5YER146W 282 nt6.96□□□□□ -1.3
UPS3Q04006 AIM1YAL046C 357 nt6.96□□□□□ -1.3
UPS3Q04006 RSC4YKR008W 1878 nt6.96□□□□□ -1.3
UPS3Q04006 RAD23YEL037C 1197 nt6.95□□□□□ -1.3
UPS3Q04006 ASP3-1YLR155C 1089 nt6.95□□□□□ -1.3
UPS3Q04006 ASP3-2YLR157C 1089 nt6.95□□□□□ -1.3
UPS3Q04006 ASP3-3YLR158C 1089 nt6.95□□□□□ -1.3
UPS3Q04006 ASP3-4YLR160C 1089 nt6.95□□□□□ -1.3
UPS3Q04006 GND1YHR183W 1470 nt6.95□□□□□ -1.3
UPS3Q04006 YMR262WYMR262W 942 nt6.94□□□□□ -1.3
UPS3Q04006 GPN2YOR262W 1044 nt6.94□□□□□ -1.3
UPS3Q04006 ADE16YLR028C 1776 nt6.93□□□□□ -1.3
UPS3Q04006 SOL2YCR073W-A 948 nt6.92□□□□□ -1.3
UPS3Q04006 INH1YDL181W 258 nt6.92□□□□□ -1.3
UPS3Q04006 AIM34YMR003W 597 nt6.92□□□□□ -1.3
UPS3Q04006 NDE1YMR145C 1683 nt6.91□□□□□ -1.3
UPS3Q04006 ORT1YOR130C 879 nt6.91□□□□□ -1.3
UPS3Q04006 snR4snR4 186 nt6.91□□□□□ -1.3
UPS3Q04006 DLD3YEL071W 1491 nt6.91□□□□□ -1.3
UPS3Q04006 KRR1YCL059C 951 nt6.9□□□□□ -1.3
UPS3Q04006 CSM1YCR086W 573 nt6.9□□□□□ -1.3
UPS3Q04006 PRY1YJL079C 900 nt6.9□□□□□ -1.3
UPS3Q04006 YLR111WYLR111W 333 nt6.9□□□□□ -1.3
UPS3Q04006 GGC1YDL198C 903 nt6.89□□□□□ -1.31
UPS3Q04006 RPT5YOR117W 1305 nt6.89□□□□□ -1.31
UPS3Q04006 AFG2YLR397C 2343 nt6.88□□□□□ -1.31
UPS3Q04006 PFS2YNL317W 1398 nt6.88□□□□□ -1.31
UPS3Q04006 OYE2YHR179W 1203 nt6.88□□□□□ -1.31
UPS3Q04006 TIP1YBR067C 633 nt6.88□□□□□ -1.31
UPS3Q04006 YIL177CYIL177C 5277 nt6.87□□□□□ -1.31
UPS3Q04006 VMA11YPL234C 495 nt6.87□□□□□ -1.31
UPS3Q04006 TOP3YLR234W 1971 nt6.86□□□□□ -1.31
UPS3Q04006 HXT12YIL170W 1374 nt6.86□□□□□ -1.31
UPS3Q04006 SMM1YNR015W 1155 nt6.86□□□□□ -1.31
UPS3Q04006 ITR1YDR497C 1755 nt6.85□□□□□ -1.31
UPS3Q04006 RIB3YDR487C 627 nt6.85□□□□□ -1.31
UPS3Q04006 RPC31YNL151C 756 nt6.85□□□□□ -1.31
UPS3Q04006 RIM2YBR192W 1134 nt6.85□□□□□ -1.31
UPS3Q04006 CTF3YLR381W 2202 nt6.85□□□□□ -1.31
UPS3Q04006 TAT2YOL020W 1779 nt6.85□□□□□ -1.31
UPS3Q04006 BEM1YBR200W 1656 nt6.84□□□□□ -1.31
UPS3Q04006 HSV2YGR223C 1347 nt6.84□□□□□ -1.31
UPS3Q04006 EAF3YPR023C 1206 nt6.83□□□□□ -1.32
UPS3Q04006 RIB7YBR153W 735 nt6.83□□□□□ -1.32
UPS3Q04006 CCR4YAL021C 2514 nt6.83□□□□□ -1.32
UPS3Q04006 YRF1-1YDR545W 5391 nt6.82□□□□□ -1.32
UPS3Q04006 YRF1-5YLR467W 5391 nt6.82□□□□□ -1.32
UPS3Q04006 YRF1-8YOR396W 5391 nt6.82□□□□□ -1.32
UPS3Q04006 YRF1-3YGR296W 5580 nt6.81□□□□□ -1.32
UPS3Q04006 YRF1-6YNL339C 5580 nt6.81□□□□□ -1.32
UPS3Q04006 YRF1-7YPL283C 5580 nt6.81□□□□□ -1.32
UPS3Q04006 HXT11YOL156W 1704 nt6.81□□□□□ -1.32
UPS3Q04006 DPL1YDR294C 1770 nt6.8□□□□□ -1.32
UPS3Q04006 CHA1YCL064C 1083 nt6.8□□□□□ -1.32
UPS3Q04006 YJL118WYJL118W 660 nt6.8□□□□□ -1.32
UPS3Q04006 LOT5YKL183W 921 nt6.8□□□□□ -1.32
UPS3Q04006 SNX3YOR357C 489 nt6.8□□□□□ -1.32
UPS3Q04006 LSB3YFR024C-A 1380 nt6.8□□□□□ -1.32
UPS3Q04006 NPP2YEL016C 1482 nt6.79□□□□□ -1.32
UPS3Q04006 MAM3YOL060C 2121 nt6.79□□□□□ -1.32
UPS3Q04006 ITR2YOL103W 1830 nt6.79□□□□□ -1.32
UPS3Q04006 VRG4YGL225W 1014 nt6.79□□□□□ -1.32
UPS3Q04006 YIL108WYIL108W 2091 nt6.79□□□□□ -1.32
UPS3Q04006 LEU4YNL104C 1860 nt6.79□□□□□ -1.32
UPS3Q04006 ERG13YML126C 1476 nt6.79□□□□□ -1.32
UPS3Q04006 TPS1YBR126C 1488 nt6.79□□□□□ -1.32
UPS3Q04006 PRC1YMR297W 1599 nt6.78□□□□□ -1.32
UPS3Q04006 TRP2YER090W 1524 nt6.78□□□□□ -1.32
UPS3Q04006 SLM3YDL033C 1254 nt6.78□□□□□ -1.32
UPS3Q04006 YMR226CYMR226C 804 nt6.78□□□□□ -1.32
UPS3Q04006 GLR1YPL091W 1452 nt6.78□□□□□ -1.32
UPS3Q04006 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt6.77□□□□□ -1.33
UPS3Q04006 SAM3YPL274W 1764 nt6.77□□□□□ -1.33
UPS3Q04006 RPN14YGL004C 1254 nt6.76□□□□□ -1.33
UPS3Q04006 ADE2YOR128C 1716 nt6.76□□□□□ -1.33
UPS3Q04006 SRM1YGL097W 1449 nt6.76□□□□□ -1.33
UPS3Q04006 YDR455CYDR455C 309 nt6.75□□□□□ -1.33
UPS3Q04006 RRT8YOL048C 1029 nt6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.3 ms