Protein–RNA interactions for Protein: Q04006

UPS3, Protein UPS3, mitochondrial, yeastyeast

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UPS3Q04006 NSR1YGR159C 1245 nt15.51■□□□□ 0.07
UPS3Q04006 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.24■□□□□ 0.03
UPS3Q04006 NOP1YDL014W 984 nt14.77□□□□□ -0.05
UPS3Q04006 MDJ1YFL016C 1536 nt14.02□□□□□ -0.16
UPS3Q04006 YKL036CYKL036C 393 nt13.19□□□□□ -0.3
UPS3Q04006 YJL027CYJL027C 417 nt13.02□□□□□ -0.33
UPS3Q04006 SSA3YBL075C 1950 nt12.92□□□□□ -0.34
UPS3Q04006 SRX1YKL086W 384 nt12.82□□□□□ -0.36
UPS3Q04006 Q0297Q0297 156 nt12.71□□□□□ -0.37
UPS3Q04006 DBP2YNL112W 1641 nt12.2□□□□□ -0.46
UPS3Q04006 YBR190WYBR190W 312 nt12.15□□□□□ -0.46
UPS3Q04006 YCR051WYCR051W 669 nt12.14□□□□□ -0.47
UPS3Q04006 RTC3YHR087W 336 nt11.88□□□□□ -0.51
UPS3Q04006 TRN1tP(UGG)A 72 nt11.77□□□□□ -0.53
UPS3Q04006 SUF9tP(UGG)F 72 nt11.77□□□□□ -0.53
UPS3Q04006 SUF8tP(UGG)H 72 nt11.77□□□□□ -0.53
UPS3Q04006 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt11.77□□□□□ -0.53
UPS3Q04006 SUF7tP(UGG)M 72 nt11.77□□□□□ -0.53
UPS3Q04006 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt11.77□□□□□ -0.53
UPS3Q04006 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt11.77□□□□□ -0.53
UPS3Q04006 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt11.77□□□□□ -0.53
UPS3Q04006 SUF11tP(UGG)O2 72 nt11.77□□□□□ -0.53
UPS3Q04006 SCS3YGL126W 1143 nt11.74□□□□□ -0.53
UPS3Q04006 CCC1YLR220W 969 nt11.67□□□□□ -0.54
UPS3Q04006 RVS167YDR388W 1449 nt11.6□□□□□ -0.55
UPS3Q04006 RPP1BYDL130W 321 nt11.41□□□□□ -0.58
UPS3Q04006 YOL085CYOL085C 342 nt11.39□□□□□ -0.59
UPS3Q04006 PUT4YOR348C 1884 nt11.26□□□□□ -0.61
UPS3Q04006 SCJ1YMR214W 1134 nt11.25□□□□□ -0.61
UPS3Q04006 PKP1YIL042C 1185 nt11.22□□□□□ -0.61
UPS3Q04006 SSA4YER103W 1929 nt11.06□□□□□ -0.64
UPS3Q04006 SHR5YOL110W 714 nt11.04□□□□□ -0.64
UPS3Q04006 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.03□□□□□ -0.64
UPS3Q04006 SPT5YML010W 3192 nt11□□□□□ -0.65
UPS3Q04006 URN1YPR152C 1398 nt10.93□□□□□ -0.66
UPS3Q04006 ARE1YCR048W 1833 nt10.9□□□□□ -0.66
UPS3Q04006 PET122YER153C 765 nt10.89□□□□□ -0.67
UPS3Q04006 PAC11YDR488C 1602 nt10.88□□□□□ -0.67
UPS3Q04006 POA1YBR022W 534 nt10.88□□□□□ -0.67
UPS3Q04006 OPI9YLR338W 858 nt10.86□□□□□ -0.67
UPS3Q04006 SAH1YER043C 1350 nt10.84□□□□□ -0.67
UPS3Q04006 SCR1SCR1 522 nt10.81□□□□□ -0.68
UPS3Q04006 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt10.8□□□□□ -0.68
UPS3Q04006 RPN10YHR200W 807 nt10.8□□□□□ -0.68
UPS3Q04006 BDF1YLR399C 2061 nt10.79□□□□□ -0.68
UPS3Q04006 NVJ2YPR091C 2313 nt10.78□□□□□ -0.68
UPS3Q04006 DEP1YAL013W 1218 nt10.78□□□□□ -0.68
UPS3Q04006 BSC6YOL137W 1494 nt10.76□□□□□ -0.69
UPS3Q04006 YDJ1YNL064C 1230 nt10.71□□□□□ -0.69
UPS3Q04006 YNL208WYNL208W 600 nt10.66□□□□□ -0.7
UPS3Q04006 TAT1YBR069C 1860 nt10.61□□□□□ -0.71
UPS3Q04006 PUN1YLR414C 792 nt10.59□□□□□ -0.71
UPS3Q04006 BUD23YCR047C 828 nt10.56□□□□□ -0.72
UPS3Q04006 RRN5YLR141W 1092 nt10.55□□□□□ -0.72
UPS3Q04006 GAR1YHR089C 618 nt10.49□□□□□ -0.73
UPS3Q04006 PTC2YER089C 1395 nt10.47□□□□□ -0.73
UPS3Q04006 FPS1YLL043W 2010 nt10.45□□□□□ -0.74
UPS3Q04006 YJR018WYJR018W 363 nt10.43□□□□□ -0.74
UPS3Q04006 NAB2YGL122C 1578 nt10.43□□□□□ -0.74
UPS3Q04006 ATS1YAL020C 1002 nt10.41□□□□□ -0.74
UPS3Q04006 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.34□□□□□ -0.75
UPS3Q04006 RSB1YOR049C 1065 nt10.27□□□□□ -0.77
UPS3Q04006 RPP2BYDR382W 333 nt10.21□□□□□ -0.77
UPS3Q04006 DAL1YIR027C 1383 nt10.2□□□□□ -0.78
UPS3Q04006 FPR4YLR449W 1179 nt10.18□□□□□ -0.78
UPS3Q04006 MEP2YNL142W 1500 nt10.17□□□□□ -0.78
UPS3Q04006 TIR1YER011W 765 nt10.17□□□□□ -0.78
UPS3Q04006 INM2YDR287W 879 nt10.15□□□□□ -0.78
UPS3Q04006 FIS1YIL065C 468 nt10.14□□□□□ -0.79
UPS3Q04006 PHO4YFR034C 939 nt10.08□□□□□ -0.8
UPS3Q04006 SSA1YAL005C 1929 nt10.05□□□□□ -0.8
UPS3Q04006 YJR120WYJR120W 351 nt10.03□□□□□ -0.8
UPS3Q04006 YPS1YLR120C 1710 nt10□□□□□ -0.81
UPS3Q04006 UME6YDR207C 2511 nt10□□□□□ -0.81
UPS3Q04006 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt9.97□□□□□ -0.81
UPS3Q04006 YBL100CYBL100C 315 nt9.95□□□□□ -0.82
UPS3Q04006 DCW1YKL046C 1350 nt9.95□□□□□ -0.82
UPS3Q04006 YMR090WYMR090W 684 nt9.94□□□□□ -0.82
UPS3Q04006 YBR220CYBR220C 1683 nt9.93□□□□□ -0.82
UPS3Q04006 YDR095CYDR095C 411 nt9.88□□□□□ -0.83
UPS3Q04006 BDH2YAL061W 1254 nt9.85□□□□□ -0.83
UPS3Q04006 EMI2YDR516C 1503 nt9.85□□□□□ -0.83
UPS3Q04006 GUT2YIL155C 1950 nt9.84□□□□□ -0.83
UPS3Q04006 PCH2YBR186W 1695 nt9.83□□□□□ -0.84
UPS3Q04006 ALF1YNL148C 765 nt9.82□□□□□ -0.84
UPS3Q04006 FUN26YAL022C 1554 nt9.8□□□□□ -0.84
UPS3Q04006 TRM9YML014W 840 nt9.78□□□□□ -0.84
UPS3Q04006 YDL221WYDL221W 552 nt9.73□□□□□ -0.85
UPS3Q04006 RPP2AYOL039W 321 nt9.73□□□□□ -0.85
UPS3Q04006 SDH1YKL148C 1923 nt9.72□□□□□ -0.85
UPS3Q04006 PIB2YGL023C 1908 nt9.7□□□□□ -0.86
UPS3Q04006 YJL225CYJL225C 5277 nt9.69□□□□□ -0.86
UPS3Q04006 PST2YDR032C 597 nt9.69□□□□□ -0.86
UPS3Q04006 SRB2YHR041C 633 nt9.69□□□□□ -0.86
UPS3Q04006 LSM3YLR438C-A 270 nt9.69□□□□□ -0.86
UPS3Q04006 SUF2tP(AGG)C 72 nt9.68□□□□□ -0.86
UPS3Q04006 SUF10tP(AGG)N 72 nt9.68□□□□□ -0.86
UPS3Q04006 SEC11YIR022W 504 nt9.68□□□□□ -0.86
UPS3Q04006 CCT6YDR188W 1641 nt9.64□□□□□ -0.87
UPS3Q04006 PTP1YDL230W 1008 nt9.62□□□□□ -0.87
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