Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP1B3P54709 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1B3P54709 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1B3P54709 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1B3P54709 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1B3P54709 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP1B3P54709 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1B3P54709 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1B3P54709 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP1B3P54709 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP1B3P54709 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP1B3P54709 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP1B3P54709 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1B3P54709 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1B3P54709 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1B3P54709 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1B3P54709 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP1B3P54709 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP1B3P54709 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP1B3P54709 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP1B3P54709 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1B3P54709 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1B3P54709 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1B3P54709 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1B3P54709 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1B3P54709 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1B3P54709 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1B3P54709 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1B3P54709 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1B3P54709 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1B3P54709 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1B3P54709 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1B3P54709 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1B3P54709 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1B3P54709 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1B3P54709 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1B3P54709 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1B3P54709 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1B3P54709 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1B3P54709 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1B3P54709 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1B3P54709 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1B3P54709 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1B3P54709 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1B3P54709 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1B3P54709 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1B3P54709 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1B3P54709 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1B3P54709 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1B3P54709 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1B3P54709 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1B3P54709 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1B3P54709 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1B3P54709 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1B3P54709 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1B3P54709 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1B3P54709 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1B3P54709 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP1B3P54709 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP1B3P54709 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1B3P54709 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1B3P54709 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1B3P54709 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1B3P54709 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1B3P54709 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1B3P54709 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1B3P54709 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1B3P54709 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1B3P54709 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1B3P54709 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1B3P54709 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1B3P54709 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1B3P54709 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1B3P54709 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1B3P54709 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1B3P54709 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1B3P54709 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP1B3P54709 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP1B3P54709 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP1B3P54709 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP1B3P54709 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP1B3P54709 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP1B3P54709 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP1B3P54709 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP1B3P54709 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP1B3P54709 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP1B3P54709 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP1B3P54709 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP1B3P54709 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP1B3P54709 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP1B3P54709 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP1B3P54709 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP1B3P54709 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP1B3P54709 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP1B3P54709 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP1B3P54709 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP1B3P54709 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP1B3P54709 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP1B3P54709 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP1B3P54709 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms