Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAPOLAP51003 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PAPOLAP51003 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PAPOLAP51003 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PAPOLAP51003 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PAPOLAP51003 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PAPOLAP51003 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PAPOLAP51003 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PAPOLAP51003 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PAPOLAP51003 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PAPOLAP51003 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PAPOLAP51003 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PAPOLAP51003 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PAPOLAP51003 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PAPOLAP51003 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PAPOLAP51003 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PAPOLAP51003 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PAPOLAP51003 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PAPOLAP51003 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PAPOLAP51003 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PAPOLAP51003 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PAPOLAP51003 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PAPOLAP51003 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PAPOLAP51003 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PAPOLAP51003 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PAPOLAP51003 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PAPOLAP51003 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PAPOLAP51003 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PAPOLAP51003 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PAPOLAP51003 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PAPOLAP51003 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PAPOLAP51003 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PAPOLAP51003 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PAPOLAP51003 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PAPOLAP51003 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PAPOLAP51003 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
PAPOLAP51003 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PAPOLAP51003 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PAPOLAP51003 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PAPOLAP51003 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PAPOLAP51003 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PAPOLAP51003 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PAPOLAP51003 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PAPOLAP51003 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAPOLAP51003 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAPOLAP51003 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PAPOLAP51003 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PAPOLAP51003 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PAPOLAP51003 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PAPOLAP51003 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAPOLAP51003 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAPOLAP51003 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAPOLAP51003 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAPOLAP51003 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PAPOLAP51003 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PAPOLAP51003 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PAPOLAP51003 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PAPOLAP51003 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PAPOLAP51003 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PAPOLAP51003 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAPOLAP51003 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAPOLAP51003 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAPOLAP51003 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAPOLAP51003 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAPOLAP51003 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAPOLAP51003 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAPOLAP51003 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAPOLAP51003 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAPOLAP51003 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PAPOLAP51003 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PAPOLAP51003 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PAPOLAP51003 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAPOLAP51003 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAPOLAP51003 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAPOLAP51003 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAPOLAP51003 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAPOLAP51003 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAPOLAP51003 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PAPOLAP51003 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAPOLAP51003 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAPOLAP51003 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAPOLAP51003 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAPOLAP51003 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAPOLAP51003 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAPOLAP51003 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAPOLAP51003 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAPOLAP51003 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAPOLAP51003 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAPOLAP51003 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAPOLAP51003 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAPOLAP51003 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAPOLAP51003 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAPOLAP51003 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAPOLAP51003 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAPOLAP51003 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAPOLAP51003 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAPOLAP51003 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAPOLAP51003 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PAPOLAP51003 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PAPOLAP51003 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms