Protein–RNA interactions for Protein: P50851

LRBA, Lipopolysaccharide-responsive and beige-like anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRBAP50851 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRBAP50851 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRBAP50851 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRBAP50851 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRBAP50851 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRBAP50851 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRBAP50851 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRBAP50851 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRBAP50851 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRBAP50851 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRBAP50851 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRBAP50851 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRBAP50851 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRBAP50851 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRBAP50851 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRBAP50851 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRBAP50851 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRBAP50851 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRBAP50851 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRBAP50851 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRBAP50851 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRBAP50851 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRBAP50851 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRBAP50851 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRBAP50851 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRBAP50851 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LRBAP50851 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRBAP50851 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRBAP50851 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRBAP50851 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRBAP50851 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRBAP50851 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRBAP50851 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRBAP50851 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRBAP50851 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRBAP50851 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRBAP50851 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRBAP50851 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRBAP50851 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRBAP50851 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRBAP50851 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRBAP50851 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRBAP50851 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRBAP50851 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRBAP50851 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRBAP50851 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRBAP50851 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRBAP50851 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRBAP50851 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRBAP50851 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRBAP50851 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRBAP50851 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRBAP50851 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRBAP50851 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRBAP50851 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRBAP50851 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRBAP50851 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRBAP50851 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
LRBAP50851 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
LRBAP50851 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRBAP50851 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRBAP50851 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRBAP50851 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRBAP50851 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRBAP50851 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRBAP50851 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRBAP50851 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRBAP50851 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRBAP50851 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRBAP50851 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRBAP50851 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRBAP50851 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRBAP50851 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRBAP50851 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRBAP50851 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRBAP50851 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRBAP50851 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LRBAP50851 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRBAP50851 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRBAP50851 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRBAP50851 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRBAP50851 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRBAP50851 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRBAP50851 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRBAP50851 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRBAP50851 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRBAP50851 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRBAP50851 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRBAP50851 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRBAP50851 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRBAP50851 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRBAP50851 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRBAP50851 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRBAP50851 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRBAP50851 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRBAP50851 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRBAP50851 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRBAP50851 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRBAP50851 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRBAP50851 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms