Protein–RNA interactions for Protein: P49750

YLPM1, YLP motif-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YLPM1P49750 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
YLPM1P49750 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YLPM1P49750 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
YLPM1P49750 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YLPM1P49750 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YLPM1P49750 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
YLPM1P49750 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YLPM1P49750 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YLPM1P49750 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
YLPM1P49750 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YLPM1P49750 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YLPM1P49750 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YLPM1P49750 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YLPM1P49750 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YLPM1P49750 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YLPM1P49750 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YLPM1P49750 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
YLPM1P49750 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YLPM1P49750 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YLPM1P49750 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YLPM1P49750 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YLPM1P49750 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YLPM1P49750 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YLPM1P49750 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
YLPM1P49750 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YLPM1P49750 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YLPM1P49750 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
YLPM1P49750 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YLPM1P49750 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YLPM1P49750 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YLPM1P49750 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YLPM1P49750 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YLPM1P49750 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YLPM1P49750 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YLPM1P49750 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YLPM1P49750 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YLPM1P49750 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YLPM1P49750 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YLPM1P49750 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YLPM1P49750 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YLPM1P49750 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YLPM1P49750 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YLPM1P49750 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YLPM1P49750 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YLPM1P49750 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YLPM1P49750 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YLPM1P49750 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YLPM1P49750 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YLPM1P49750 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YLPM1P49750 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YLPM1P49750 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YLPM1P49750 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YLPM1P49750 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YLPM1P49750 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YLPM1P49750 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YLPM1P49750 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YLPM1P49750 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YLPM1P49750 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YLPM1P49750 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YLPM1P49750 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YLPM1P49750 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
YLPM1P49750 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
YLPM1P49750 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
YLPM1P49750 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YLPM1P49750 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YLPM1P49750 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YLPM1P49750 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YLPM1P49750 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YLPM1P49750 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
YLPM1P49750 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
YLPM1P49750 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
YLPM1P49750 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
YLPM1P49750 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
YLPM1P49750 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
YLPM1P49750 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YLPM1P49750 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YLPM1P49750 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
YLPM1P49750 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YLPM1P49750 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YLPM1P49750 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YLPM1P49750 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YLPM1P49750 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YLPM1P49750 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YLPM1P49750 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YLPM1P49750 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YLPM1P49750 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YLPM1P49750 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YLPM1P49750 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YLPM1P49750 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YLPM1P49750 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YLPM1P49750 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
YLPM1P49750 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YLPM1P49750 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YLPM1P49750 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YLPM1P49750 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YLPM1P49750 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YLPM1P49750 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YLPM1P49750 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YLPM1P49750 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YLPM1P49750 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms