Protein–RNA interactions for Protein: P49447

CYB561, Cytochrome b561, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561P49447 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYB561P49447 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYB561P49447 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYB561P49447 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYB561P49447 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYB561P49447 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYB561P49447 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYB561P49447 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYB561P49447 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYB561P49447 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYB561P49447 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYB561P49447 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYB561P49447 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYB561P49447 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYB561P49447 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYB561P49447 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYB561P49447 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYB561P49447 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYB561P49447 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CYB561P49447 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYB561P49447 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYB561P49447 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYB561P49447 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CYB561P49447 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYB561P49447 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYB561P49447 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYB561P49447 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYB561P49447 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYB561P49447 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CYB561P49447 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYB561P49447 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYB561P49447 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYB561P49447 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYB561P49447 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYB561P49447 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CYB561P49447 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYB561P49447 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYB561P49447 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYB561P49447 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYB561P49447 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYB561P49447 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYB561P49447 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYB561P49447 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYB561P49447 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYB561P49447 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYB561P49447 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYB561P49447 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYB561P49447 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CYB561P49447 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CYB561P49447 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CYB561P49447 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYB561P49447 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYB561P49447 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYB561P49447 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYB561P49447 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYB561P49447 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYB561P49447 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYB561P49447 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYB561P49447 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYB561P49447 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYB561P49447 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CYB561P49447 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYB561P49447 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYB561P49447 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CYB561P49447 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CYB561P49447 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYB561P49447 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYB561P49447 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYB561P49447 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYB561P49447 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYB561P49447 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CYB561P49447 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYB561P49447 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYB561P49447 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CYB561P49447 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CYB561P49447 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYB561P49447 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYB561P49447 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYB561P49447 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYB561P49447 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYB561P49447 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CYB561P49447 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CYB561P49447 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYB561P49447 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYB561P49447 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CYB561P49447 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYB561P49447 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYB561P49447 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYB561P49447 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYB561P49447 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYB561P49447 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYB561P49447 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYB561P49447 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYB561P49447 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CYB561P49447 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYB561P49447 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYB561P49447 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYB561P49447 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYB561P49447 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYB561P49447 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms