Protein–RNA interactions for Protein: P48664

SLC1A6, Excitatory amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A6P48664 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC1A6P48664 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC1A6P48664 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC1A6P48664 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC1A6P48664 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC1A6P48664 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A6P48664 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A6P48664 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A6P48664 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC1A6P48664 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC1A6P48664 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC1A6P48664 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC1A6P48664 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC1A6P48664 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC1A6P48664 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC1A6P48664 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC1A6P48664 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC1A6P48664 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC1A6P48664 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC1A6P48664 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC1A6P48664 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC1A6P48664 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC1A6P48664 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC1A6P48664 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC1A6P48664 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC1A6P48664 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC1A6P48664 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC1A6P48664 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC1A6P48664 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC1A6P48664 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC1A6P48664 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC1A6P48664 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC1A6P48664 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC1A6P48664 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC1A6P48664 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC1A6P48664 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC1A6P48664 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC1A6P48664 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC1A6P48664 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC1A6P48664 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC1A6P48664 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC1A6P48664 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC1A6P48664 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC1A6P48664 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC1A6P48664 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC1A6P48664 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC1A6P48664 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC1A6P48664 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC1A6P48664 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC1A6P48664 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC1A6P48664 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC1A6P48664 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC1A6P48664 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC1A6P48664 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC1A6P48664 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC1A6P48664 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC1A6P48664 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC1A6P48664 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC1A6P48664 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC1A6P48664 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC1A6P48664 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC1A6P48664 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC1A6P48664 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC1A6P48664 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC1A6P48664 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC1A6P48664 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC1A6P48664 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC1A6P48664 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC1A6P48664 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC1A6P48664 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC1A6P48664 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC1A6P48664 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC1A6P48664 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC1A6P48664 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC1A6P48664 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC1A6P48664 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC1A6P48664 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC1A6P48664 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC1A6P48664 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC1A6P48664 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC1A6P48664 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC1A6P48664 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC1A6P48664 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC1A6P48664 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC1A6P48664 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC1A6P48664 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC1A6P48664 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC1A6P48664 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC1A6P48664 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC1A6P48664 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC1A6P48664 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC1A6P48664 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC1A6P48664 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC1A6P48664 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC1A6P48664 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC1A6P48664 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC1A6P48664 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC1A6P48664 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC1A6P48664 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC1A6P48664 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms