Protein–RNA interactions for Protein: P48066

SLC6A11, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A11P48066 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC6A11P48066 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC6A11P48066 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC6A11P48066 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC6A11P48066 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC6A11P48066 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC6A11P48066 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC6A11P48066 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC6A11P48066 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC6A11P48066 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC6A11P48066 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC6A11P48066 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC6A11P48066 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC6A11P48066 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC6A11P48066 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC6A11P48066 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC6A11P48066 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC6A11P48066 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC6A11P48066 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC6A11P48066 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC6A11P48066 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC6A11P48066 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC6A11P48066 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC6A11P48066 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC6A11P48066 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC6A11P48066 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC6A11P48066 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC6A11P48066 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC6A11P48066 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC6A11P48066 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC6A11P48066 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC6A11P48066 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC6A11P48066 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC6A11P48066 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC6A11P48066 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC6A11P48066 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC6A11P48066 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC6A11P48066 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC6A11P48066 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC6A11P48066 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC6A11P48066 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC6A11P48066 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC6A11P48066 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC6A11P48066 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC6A11P48066 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC6A11P48066 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC6A11P48066 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC6A11P48066 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC6A11P48066 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC6A11P48066 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC6A11P48066 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC6A11P48066 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC6A11P48066 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC6A11P48066 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC6A11P48066 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC6A11P48066 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC6A11P48066 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC6A11P48066 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC6A11P48066 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC6A11P48066 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC6A11P48066 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC6A11P48066 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC6A11P48066 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC6A11P48066 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC6A11P48066 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC6A11P48066 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC6A11P48066 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC6A11P48066 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC6A11P48066 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC6A11P48066 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC6A11P48066 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC6A11P48066 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC6A11P48066 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC6A11P48066 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC6A11P48066 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC6A11P48066 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC6A11P48066 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC6A11P48066 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC6A11P48066 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC6A11P48066 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC6A11P48066 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SLC6A11P48066 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC6A11P48066 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC6A11P48066 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC6A11P48066 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC6A11P48066 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC6A11P48066 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC6A11P48066 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC6A11P48066 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC6A11P48066 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC6A11P48066 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC6A11P48066 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC6A11P48066 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC6A11P48066 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC6A11P48066 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC6A11P48066 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC6A11P48066 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC6A11P48066 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC6A11P48066 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC6A11P48066 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms