Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP214P35658 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP214P35658 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP214P35658 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NUP214P35658 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP214P35658 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP214P35658 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP214P35658 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP214P35658 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP214P35658 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP214P35658 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP214P35658 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP214P35658 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP214P35658 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP214P35658 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP214P35658 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP214P35658 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP214P35658 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP214P35658 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP214P35658 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP214P35658 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP214P35658 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP214P35658 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP214P35658 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP214P35658 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP214P35658 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP214P35658 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP214P35658 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP214P35658 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP214P35658 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP214P35658 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP214P35658 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP214P35658 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP214P35658 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP214P35658 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP214P35658 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP214P35658 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP214P35658 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP214P35658 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP214P35658 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP214P35658 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP214P35658 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUP214P35658 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP214P35658 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP214P35658 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP214P35658 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP214P35658 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP214P35658 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP214P35658 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP214P35658 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP214P35658 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP214P35658 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP214P35658 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP214P35658 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP214P35658 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP214P35658 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP214P35658 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP214P35658 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP214P35658 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP214P35658 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP214P35658 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP214P35658 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP214P35658 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP214P35658 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP214P35658 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP214P35658 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP214P35658 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP214P35658 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP214P35658 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP214P35658 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUP214P35658 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP214P35658 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP214P35658 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP214P35658 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP214P35658 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP214P35658 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP214P35658 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP214P35658 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP214P35658 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP214P35658 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP214P35658 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP214P35658 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP214P35658 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP214P35658 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP214P35658 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP214P35658 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP214P35658 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP214P35658 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP214P35658 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP214P35658 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NUP214P35658 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP214P35658 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP214P35658 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP214P35658 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP214P35658 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP214P35658 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP214P35658 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP214P35658 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP214P35658 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP214P35658 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms