Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXD11P31277 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXD11P31277 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXD11P31277 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXD11P31277 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXD11P31277 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXD11P31277 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXD11P31277 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXD11P31277 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXD11P31277 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXD11P31277 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXD11P31277 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXD11P31277 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXD11P31277 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXD11P31277 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXD11P31277 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXD11P31277 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXD11P31277 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXD11P31277 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXD11P31277 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXD11P31277 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXD11P31277 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXD11P31277 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXD11P31277 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXD11P31277 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXD11P31277 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXD11P31277 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXD11P31277 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXD11P31277 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXD11P31277 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXD11P31277 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXD11P31277 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXD11P31277 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXD11P31277 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXD11P31277 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXD11P31277 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXD11P31277 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXD11P31277 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXD11P31277 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXD11P31277 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXD11P31277 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXD11P31277 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXD11P31277 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXD11P31277 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXD11P31277 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXD11P31277 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXD11P31277 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXD11P31277 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXD11P31277 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXD11P31277 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXD11P31277 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXD11P31277 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXD11P31277 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXD11P31277 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXD11P31277 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXD11P31277 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXD11P31277 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXD11P31277 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXD11P31277 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXD11P31277 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXD11P31277 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXD11P31277 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXD11P31277 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXD11P31277 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXD11P31277 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXD11P31277 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXD11P31277 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXD11P31277 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXD11P31277 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXD11P31277 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXD11P31277 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXD11P31277 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXD11P31277 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXD11P31277 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXD11P31277 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXD11P31277 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXD11P31277 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXD11P31277 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXD11P31277 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXD11P31277 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXD11P31277 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXD11P31277 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXD11P31277 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXD11P31277 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXD11P31277 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXD11P31277 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXD11P31277 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXD11P31277 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXD11P31277 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXD11P31277 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXD11P31277 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXD11P31277 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXD11P31277 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXD11P31277 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXD11P31277 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXD11P31277 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXD11P31277 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXD11P31277 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXD11P31277 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXD11P31277 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms