Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRABP1P29762 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRABP1P29762 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRABP1P29762 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRABP1P29762 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRABP1P29762 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRABP1P29762 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CRABP1P29762 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRABP1P29762 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRABP1P29762 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRABP1P29762 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRABP1P29762 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CRABP1P29762 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRABP1P29762 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRABP1P29762 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRABP1P29762 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRABP1P29762 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CRABP1P29762 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRABP1P29762 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRABP1P29762 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRABP1P29762 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRABP1P29762 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CRABP1P29762 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRABP1P29762 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRABP1P29762 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRABP1P29762 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRABP1P29762 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRABP1P29762 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRABP1P29762 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRABP1P29762 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRABP1P29762 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRABP1P29762 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRABP1P29762 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRABP1P29762 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRABP1P29762 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRABP1P29762 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRABP1P29762 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CRABP1P29762 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRABP1P29762 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRABP1P29762 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRABP1P29762 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRABP1P29762 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRABP1P29762 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRABP1P29762 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRABP1P29762 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRABP1P29762 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRABP1P29762 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRABP1P29762 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRABP1P29762 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRABP1P29762 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRABP1P29762 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRABP1P29762 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRABP1P29762 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRABP1P29762 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRABP1P29762 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRABP1P29762 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRABP1P29762 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRABP1P29762 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRABP1P29762 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRABP1P29762 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRABP1P29762 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRABP1P29762 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRABP1P29762 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRABP1P29762 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRABP1P29762 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRABP1P29762 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRABP1P29762 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRABP1P29762 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRABP1P29762 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRABP1P29762 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRABP1P29762 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRABP1P29762 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRABP1P29762 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRABP1P29762 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRABP1P29762 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRABP1P29762 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRABP1P29762 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRABP1P29762 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRABP1P29762 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRABP1P29762 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRABP1P29762 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRABP1P29762 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRABP1P29762 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRABP1P29762 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRABP1P29762 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRABP1P29762 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRABP1P29762 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRABP1P29762 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CRABP1P29762 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRABP1P29762 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRABP1P29762 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CRABP1P29762 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRABP1P29762 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRABP1P29762 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRABP1P29762 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRABP1P29762 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CRABP1P29762 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRABP1P29762 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRABP1P29762 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRABP1P29762 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms