Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CASP1P29466 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CASP1P29466 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CASP1P29466 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CASP1P29466 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CASP1P29466 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
CASP1P29466 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CASP1P29466 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CASP1P29466 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CASP1P29466 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CASP1P29466 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CASP1P29466 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CASP1P29466 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CASP1P29466 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CASP1P29466 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CASP1P29466 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CASP1P29466 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CASP1P29466 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CASP1P29466 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CASP1P29466 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CASP1P29466 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CASP1P29466 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CASP1P29466 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CASP1P29466 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CASP1P29466 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CASP1P29466 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CASP1P29466 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CASP1P29466 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CASP1P29466 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CASP1P29466 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CASP1P29466 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CASP1P29466 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CASP1P29466 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CASP1P29466 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CASP1P29466 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CASP1P29466 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CASP1P29466 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CASP1P29466 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CASP1P29466 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CASP1P29466 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CASP1P29466 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CASP1P29466 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CASP1P29466 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CASP1P29466 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CASP1P29466 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CASP1P29466 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CASP1P29466 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CASP1P29466 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CASP1P29466 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CASP1P29466 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CASP1P29466 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CASP1P29466 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CASP1P29466 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CASP1P29466 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CASP1P29466 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CASP1P29466 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CASP1P29466 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CASP1P29466 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CASP1P29466 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CASP1P29466 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CASP1P29466 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CASP1P29466 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CASP1P29466 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CASP1P29466 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CASP1P29466 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CASP1P29466 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CASP1P29466 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CASP1P29466 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CASP1P29466 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CASP1P29466 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CASP1P29466 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CASP1P29466 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CASP1P29466 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CASP1P29466 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CASP1P29466 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CASP1P29466 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CASP1P29466 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CASP1P29466 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CASP1P29466 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CASP1P29466 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CASP1P29466 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CASP1P29466 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CASP1P29466 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CASP1P29466 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CASP1P29466 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CASP1P29466 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CASP1P29466 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CASP1P29466 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CASP1P29466 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CASP1P29466 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CASP1P29466 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CASP1P29466 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CASP1P29466 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CASP1P29466 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CASP1P29466 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CASP1P29466 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CASP1P29466 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CASP1P29466 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CASP1P29466 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CASP1P29466 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms