Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTR2AP28223 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTR2AP28223 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTR2AP28223 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTR2AP28223 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTR2AP28223 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTR2AP28223 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTR2AP28223 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTR2AP28223 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTR2AP28223 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTR2AP28223 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTR2AP28223 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTR2AP28223 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTR2AP28223 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTR2AP28223 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTR2AP28223 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTR2AP28223 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTR2AP28223 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTR2AP28223 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTR2AP28223 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTR2AP28223 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTR2AP28223 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTR2AP28223 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTR2AP28223 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTR2AP28223 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTR2AP28223 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HTR2AP28223 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HTR2AP28223 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HTR2AP28223 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HTR2AP28223 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTR2AP28223 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTR2AP28223 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTR2AP28223 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTR2AP28223 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTR2AP28223 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTR2AP28223 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTR2AP28223 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTR2AP28223 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTR2AP28223 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTR2AP28223 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTR2AP28223 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTR2AP28223 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTR2AP28223 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HTR2AP28223 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTR2AP28223 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTR2AP28223 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTR2AP28223 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTR2AP28223 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTR2AP28223 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTR2AP28223 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTR2AP28223 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTR2AP28223 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTR2AP28223 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTR2AP28223 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTR2AP28223 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTR2AP28223 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTR2AP28223 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTR2AP28223 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTR2AP28223 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTR2AP28223 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTR2AP28223 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTR2AP28223 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTR2AP28223 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTR2AP28223 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTR2AP28223 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTR2AP28223 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTR2AP28223 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTR2AP28223 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTR2AP28223 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTR2AP28223 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTR2AP28223 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTR2AP28223 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTR2AP28223 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTR2AP28223 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTR2AP28223 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HTR2AP28223 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTR2AP28223 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTR2AP28223 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTR2AP28223 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HTR2AP28223 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HTR2AP28223 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HTR2AP28223 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HTR2AP28223 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HTR2AP28223 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HTR2AP28223 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTR2AP28223 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTR2AP28223 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTR2AP28223 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTR2AP28223 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTR2AP28223 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTR2AP28223 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTR2AP28223 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTR2AP28223 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTR2AP28223 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTR2AP28223 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTR2AP28223 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTR2AP28223 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTR2AP28223 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTR2AP28223 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTR2AP28223 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms