Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BGNP21810 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BGNP21810 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BGNP21810 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BGNP21810 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BGNP21810 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BGNP21810 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BGNP21810 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BGNP21810 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BGNP21810 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BGNP21810 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BGNP21810 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BGNP21810 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BGNP21810 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
BGNP21810 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BGNP21810 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BGNP21810 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BGNP21810 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BGNP21810 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BGNP21810 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BGNP21810 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BGNP21810 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BGNP21810 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BGNP21810 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BGNP21810 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BGNP21810 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BGNP21810 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BGNP21810 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BGNP21810 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BGNP21810 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BGNP21810 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BGNP21810 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BGNP21810 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BGNP21810 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BGNP21810 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BGNP21810 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BGNP21810 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BGNP21810 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BGNP21810 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BGNP21810 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BGNP21810 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BGNP21810 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BGNP21810 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
BGNP21810 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BGNP21810 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
BGNP21810 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BGNP21810 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BGNP21810 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BGNP21810 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BGNP21810 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BGNP21810 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BGNP21810 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BGNP21810 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BGNP21810 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BGNP21810 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BGNP21810 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BGNP21810 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BGNP21810 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BGNP21810 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BGNP21810 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BGNP21810 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BGNP21810 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BGNP21810 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BGNP21810 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BGNP21810 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BGNP21810 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BGNP21810 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BGNP21810 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BGNP21810 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BGNP21810 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BGNP21810 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BGNP21810 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BGNP21810 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BGNP21810 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BGNP21810 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BGNP21810 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BGNP21810 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BGNP21810 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BGNP21810 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BGNP21810 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BGNP21810 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BGNP21810 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BGNP21810 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BGNP21810 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BGNP21810 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BGNP21810 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BGNP21810 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BGNP21810 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BGNP21810 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BGNP21810 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BGNP21810 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BGNP21810 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BGNP21810 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BGNP21810 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BGNP21810 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BGNP21810 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BGNP21810 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BGNP21810 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BGNP21810 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BGNP21810 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms