Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDCP19113 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDCP19113 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDCP19113 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDCP19113 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDCP19113 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HDCP19113 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HDCP19113 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HDCP19113 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HDCP19113 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HDCP19113 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HDCP19113 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HDCP19113 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HDCP19113 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
HDCP19113 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HDCP19113 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HDCP19113 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HDCP19113 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HDCP19113 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
HDCP19113 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HDCP19113 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDCP19113 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDCP19113 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDCP19113 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDCP19113 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDCP19113 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDCP19113 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDCP19113 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDCP19113 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDCP19113 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDCP19113 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HDCP19113 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDCP19113 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDCP19113 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDCP19113 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDCP19113 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDCP19113 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDCP19113 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDCP19113 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDCP19113 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDCP19113 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
HDCP19113 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDCP19113 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDCP19113 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDCP19113 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDCP19113 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDCP19113 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDCP19113 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDCP19113 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDCP19113 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDCP19113 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDCP19113 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
HDCP19113 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
HDCP19113 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
HDCP19113 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDCP19113 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HDCP19113 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HDCP19113 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDCP19113 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDCP19113 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
HDCP19113 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDCP19113 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HDCP19113 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HDCP19113 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDCP19113 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDCP19113 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDCP19113 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDCP19113 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDCP19113 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDCP19113 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDCP19113 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
HDCP19113 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDCP19113 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HDCP19113 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDCP19113 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDCP19113 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDCP19113 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDCP19113 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDCP19113 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDCP19113 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HDCP19113 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HDCP19113 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDCP19113 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDCP19113 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDCP19113 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDCP19113 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDCP19113 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDCP19113 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDCP19113 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDCP19113 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
HDCP19113 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDCP19113 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDCP19113 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDCP19113 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDCP19113 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDCP19113 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HDCP19113 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDCP19113 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDCP19113 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDCP19113 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms