Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCK1P16333 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCK1P16333 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCK1P16333 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCK1P16333 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCK1P16333 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCK1P16333 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCK1P16333 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCK1P16333 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCK1P16333 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCK1P16333 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCK1P16333 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCK1P16333 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCK1P16333 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCK1P16333 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCK1P16333 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCK1P16333 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCK1P16333 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCK1P16333 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCK1P16333 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCK1P16333 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCK1P16333 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCK1P16333 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCK1P16333 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCK1P16333 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCK1P16333 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCK1P16333 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCK1P16333 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NCK1P16333 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCK1P16333 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCK1P16333 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCK1P16333 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCK1P16333 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCK1P16333 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCK1P16333 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCK1P16333 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCK1P16333 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCK1P16333 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCK1P16333 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCK1P16333 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCK1P16333 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCK1P16333 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCK1P16333 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCK1P16333 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCK1P16333 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCK1P16333 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NCK1P16333 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCK1P16333 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCK1P16333 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCK1P16333 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCK1P16333 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCK1P16333 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NCK1P16333 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCK1P16333 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCK1P16333 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCK1P16333 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCK1P16333 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCK1P16333 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCK1P16333 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCK1P16333 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCK1P16333 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCK1P16333 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCK1P16333 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCK1P16333 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCK1P16333 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCK1P16333 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCK1P16333 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCK1P16333 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCK1P16333 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCK1P16333 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCK1P16333 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCK1P16333 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCK1P16333 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCK1P16333 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCK1P16333 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCK1P16333 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCK1P16333 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCK1P16333 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCK1P16333 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NCK1P16333 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCK1P16333 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCK1P16333 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCK1P16333 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCK1P16333 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCK1P16333 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCK1P16333 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCK1P16333 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCK1P16333 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCK1P16333 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCK1P16333 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCK1P16333 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCK1P16333 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCK1P16333 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCK1P16333 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCK1P16333 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCK1P16333 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCK1P16333 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCK1P16333 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCK1P16333 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCK1P16333 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms