Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFITM1P13164 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
IFITM1P13164 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFITM1P13164 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFITM1P13164 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFITM1P13164 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFITM1P13164 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFITM1P13164 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFITM1P13164 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFITM1P13164 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFITM1P13164 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFITM1P13164 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFITM1P13164 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFITM1P13164 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFITM1P13164 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFITM1P13164 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFITM1P13164 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFITM1P13164 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFITM1P13164 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFITM1P13164 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFITM1P13164 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFITM1P13164 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFITM1P13164 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFITM1P13164 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFITM1P13164 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFITM1P13164 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFITM1P13164 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFITM1P13164 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFITM1P13164 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFITM1P13164 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFITM1P13164 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFITM1P13164 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFITM1P13164 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFITM1P13164 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFITM1P13164 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFITM1P13164 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFITM1P13164 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFITM1P13164 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFITM1P13164 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFITM1P13164 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFITM1P13164 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
IFITM1P13164 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFITM1P13164 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFITM1P13164 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFITM1P13164 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFITM1P13164 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFITM1P13164 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFITM1P13164 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFITM1P13164 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFITM1P13164 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFITM1P13164 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IFITM1P13164 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFITM1P13164 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFITM1P13164 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFITM1P13164 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFITM1P13164 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFITM1P13164 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFITM1P13164 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IFITM1P13164 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFITM1P13164 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFITM1P13164 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFITM1P13164 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFITM1P13164 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFITM1P13164 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFITM1P13164 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFITM1P13164 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFITM1P13164 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFITM1P13164 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFITM1P13164 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFITM1P13164 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFITM1P13164 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFITM1P13164 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFITM1P13164 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFITM1P13164 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFITM1P13164 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFITM1P13164 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFITM1P13164 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFITM1P13164 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFITM1P13164 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFITM1P13164 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFITM1P13164 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFITM1P13164 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFITM1P13164 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFITM1P13164 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFITM1P13164 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IFITM1P13164 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFITM1P13164 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
IFITM1P13164 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
IFITM1P13164 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
IFITM1P13164 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IFITM1P13164 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFITM1P13164 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFITM1P13164 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFITM1P13164 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFITM1P13164 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFITM1P13164 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFITM1P13164 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFITM1P13164 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFITM1P13164 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFITM1P13164 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms