Protein–RNA interactions for Protein: P11831

SRF, Serum response factor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFP11831 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRFP11831 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRFP11831 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SRFP11831 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SRFP11831 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRFP11831 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRFP11831 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRFP11831 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRFP11831 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRFP11831 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRFP11831 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRFP11831 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRFP11831 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRFP11831 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRFP11831 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRFP11831 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRFP11831 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRFP11831 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRFP11831 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SRFP11831 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRFP11831 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRFP11831 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRFP11831 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRFP11831 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRFP11831 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRFP11831 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRFP11831 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRFP11831 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRFP11831 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRFP11831 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRFP11831 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRFP11831 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SRFP11831 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRFP11831 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRFP11831 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRFP11831 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRFP11831 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRFP11831 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRFP11831 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRFP11831 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRFP11831 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRFP11831 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRFP11831 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRFP11831 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRFP11831 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SRFP11831 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRFP11831 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRFP11831 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRFP11831 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRFP11831 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRFP11831 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRFP11831 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRFP11831 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRFP11831 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRFP11831 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRFP11831 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRFP11831 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRFP11831 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRFP11831 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRFP11831 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRFP11831 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SRFP11831 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SRFP11831 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
SRFP11831 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRFP11831 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRFP11831 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRFP11831 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRFP11831 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRFP11831 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRFP11831 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRFP11831 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRFP11831 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRFP11831 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRFP11831 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRFP11831 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRFP11831 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRFP11831 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRFP11831 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRFP11831 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRFP11831 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRFP11831 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRFP11831 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRFP11831 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRFP11831 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRFP11831 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRFP11831 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRFP11831 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRFP11831 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRFP11831 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRFP11831 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRFP11831 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRFP11831 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRFP11831 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRFP11831 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRFP11831 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRFP11831 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRFP11831 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRFP11831 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SRFP11831 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRFP11831 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms