Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATXN8OSP0DMR3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATXN8OSP0DMR3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATXN8OSP0DMR3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATXN8OSP0DMR3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATXN8OSP0DMR3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATXN8OSP0DMR3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATXN8OSP0DMR3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATXN8OSP0DMR3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATXN8OSP0DMR3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATXN8OSP0DMR3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATXN8OSP0DMR3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATXN8OSP0DMR3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATXN8OSP0DMR3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATXN8OSP0DMR3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATXN8OSP0DMR3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATXN8OSP0DMR3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ATXN8OSP0DMR3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATXN8OSP0DMR3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATXN8OSP0DMR3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATXN8OSP0DMR3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATXN8OSP0DMR3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATXN8OSP0DMR3 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATXN8OSP0DMR3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATXN8OSP0DMR3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATXN8OSP0DMR3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATXN8OSP0DMR3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATXN8OSP0DMR3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATXN8OSP0DMR3 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATXN8OSP0DMR3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATXN8OSP0DMR3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATXN8OSP0DMR3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATXN8OSP0DMR3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATXN8OSP0DMR3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATXN8OSP0DMR3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATXN8OSP0DMR3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATXN8OSP0DMR3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATXN8OSP0DMR3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATXN8OSP0DMR3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATXN8OSP0DMR3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ATXN8OSP0DMR3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATXN8OSP0DMR3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATXN8OSP0DMR3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATXN8OSP0DMR3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATXN8OSP0DMR3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATXN8OSP0DMR3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATXN8OSP0DMR3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATXN8OSP0DMR3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATXN8OSP0DMR3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATXN8OSP0DMR3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATXN8OSP0DMR3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATXN8OSP0DMR3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATXN8OSP0DMR3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATXN8OSP0DMR3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATXN8OSP0DMR3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATXN8OSP0DMR3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATXN8OSP0DMR3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATXN8OSP0DMR3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATXN8OSP0DMR3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATXN8OSP0DMR3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATXN8OSP0DMR3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATXN8OSP0DMR3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATXN8OSP0DMR3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATXN8OSP0DMR3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATXN8OSP0DMR3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATXN8OSP0DMR3 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATXN8OSP0DMR3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATXN8OSP0DMR3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATXN8OSP0DMR3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATXN8OSP0DMR3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATXN8OSP0DMR3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATXN8OSP0DMR3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATXN8OSP0DMR3 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATXN8OSP0DMR3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATXN8OSP0DMR3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATXN8OSP0DMR3 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATXN8OSP0DMR3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATXN8OSP0DMR3 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATXN8OSP0DMR3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATXN8OSP0DMR3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATXN8OSP0DMR3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATXN8OSP0DMR3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATXN8OSP0DMR3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATXN8OSP0DMR3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATXN8OSP0DMR3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATXN8OSP0DMR3 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATXN8OSP0DMR3 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATXN8OSP0DMR3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATXN8OSP0DMR3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATXN8OSP0DMR3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATXN8OSP0DMR3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATXN8OSP0DMR3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATXN8OSP0DMR3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATXN8OSP0DMR3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATXN8OSP0DMR3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATXN8OSP0DMR3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATXN8OSP0DMR3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATXN8OSP0DMR3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATXN8OSP0DMR3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATXN8OSP0DMR3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
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